221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1134 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  100 
 
 
498 aa  986  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  48.39 
 
 
484 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  47.97 
 
 
484 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  47.84 
 
 
484 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  48.27 
 
 
484 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  46.47 
 
 
484 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  47.54 
 
 
484 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  46.25 
 
 
484 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  48.84 
 
 
490 aa  415  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  4.55151e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  45 
 
 
481 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  45.42 
 
 
481 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  44.38 
 
 
482 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  48.39 
 
 
483 aa  405  1e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  45.55 
 
 
466 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  44.58 
 
 
481 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  48.73 
 
 
484 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  48.2 
 
 
484 aa  400  1e-110  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  45.37 
 
 
466 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  44.51 
 
 
482 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  43.84 
 
 
480 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  46.64 
 
 
484 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  47.15 
 
 
484 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  43.12 
 
 
482 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  45.57 
 
 
484 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  45.78 
 
 
484 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  44.61 
 
 
500 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  46.51 
 
 
483 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  46.09 
 
 
484 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  45.55 
 
 
481 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  43.66 
 
 
480 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  43.66 
 
 
480 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  43.04 
 
 
480 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  42.59 
 
 
480 aa  363  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  43.45 
 
 
480 aa  362  9e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  1.65872e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  42.38 
 
 
480 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  42.83 
 
 
484 aa  359  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  43.04 
 
 
480 aa  359  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  40.59 
 
 
480 aa  357  3e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  42.83 
 
 
480 aa  355  8e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  42.62 
 
 
480 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  42.62 
 
 
480 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  42.62 
 
 
480 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  42.62 
 
 
480 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04543e-06 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  43.85 
 
 
485 aa  352  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  42.48 
 
 
498 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  42.57 
 
 
472 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  45.16 
 
 
510 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  42.62 
 
 
480 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  43.69 
 
 
484 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  42.13 
 
 
466 aa  341  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  39.75 
 
 
482 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  39.75 
 
 
482 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  45.33 
 
 
493 aa  323  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  38.59 
 
 
482 aa  322  1e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  37.95 
 
 
481 aa  319  6e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  40.46 
 
 
484 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  38.99 
 
 
481 aa  315  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  39.63 
 
 
482 aa  314  3e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  39.92 
 
 
484 aa  305  1e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  39.71 
 
 
484 aa  303  5e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.57 
 
 
483 aa  293  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  36.8 
 
 
491 aa  285  1e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  35.34 
 
 
479 aa  285  1e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  36.17 
 
 
485 aa  283  4e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  38.24 
 
 
485 aa  282  8e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  40.46 
 
 
483 aa  279  7e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  37.34 
 
 
488 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  36.51 
 
 
485 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  37.04 
 
 
498 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  38.22 
 
 
485 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  39.38 
 
 
482 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.31 
 
 
485 aa  275  1e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  37.26 
 
 
466 aa  274  2e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  39.06 
 
 
483 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  37.5 
 
 
483 aa  274  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  37.95 
 
 
481 aa  273  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  37.01 
 
 
485 aa  273  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  37.24 
 
 
481 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  38.76 
 
 
485 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  33.2 
 
 
485 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  33.75 
 
 
483 aa  270  3e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.48 
 
 
483 aa  271  3e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  38.22 
 
 
483 aa  270  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  37.87 
 
 
485 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  36.61 
 
 
494 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  37.99 
 
 
483 aa  267  3e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  37.84 
 
 
485 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  35.73 
 
 
487 aa  267  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  37.84 
 
 
485 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  37.84 
 
 
485 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  38.11 
 
 
485 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  37.84 
 
 
485 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99675e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  34.96 
 
 
484 aa  266  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  37.89 
 
 
485 aa  266  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.91681e-06  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  37.89 
 
 
485 aa  266  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  3.66479e-08 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  35.7 
 
 
482 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  38.38 
 
 
482 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  36.36 
 
 
485 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  35.8 
 
 
488 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  36.21 
 
 
486 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>