More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1130 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  177  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  176  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  175  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  173  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  169  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  168  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 
112 aa  167  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  167  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  167  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  167  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 
112 aa  167  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 
112 aa  167  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  166  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  70.54 
 
 
112 aa  166  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  165  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 
112 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 
112 aa  166  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1302  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54202  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 
112 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  166  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  165  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  69.64 
 
 
112 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
116 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  164  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
116 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  164  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  70.54 
 
 
112 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  164  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  163  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  70.54 
 
 
112 aa  163  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  163  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
136 aa  163  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
136 aa  163  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  68.75 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  69.64 
 
 
116 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  69.64 
 
 
112 aa  161  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0143  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  161  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  161  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
121 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4056  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.559435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  69.64 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  160  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  160  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 
112 aa  160  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 
112 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  159  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  67.86 
 
 
112 aa  160  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  67.86 
 
 
112 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>