More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1097 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1097  PP-loop protein  100 
 
 		 462 aa  878    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.873661  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1254  cell cycle protein MesJ, putative  31.27 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0978  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  36.54 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0172584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1097  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.93 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0878  cell cycle protein MesJ  26.72 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3082  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.2 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  46.08 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381977  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.5 
 
 		 417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  43.63 
 
 		 371 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4744  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  46.57 
 
 		 346 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6875  tRNA(Ile)-lysidine synthase  46.12 
 
 		 358 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487527  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0666  cell cycle protein  45.41 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.43 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378443  normal  0.301003 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2319  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.41 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.074868  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1316  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.19 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1817  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  48.35 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19753  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4142  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  44.95 
 
 		 347 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0365  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.39 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.39 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0689  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.66 
 
 		 409 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  32.97 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1208  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.42 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.429523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0850  hypothetical protein  40.76 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1222  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.88 
 
 		 456 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0565  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.17 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0825  hypothetical protein  40.76 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.28 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3626  hypothetical protein  33.06 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2413  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.06 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  36.03 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3637  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.75 
 
 		 400 aa  109  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.845838  normal  0.200954 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2410  tRNA(Ile)-lysidine synthase  35.98 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1237  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0779  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0526339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5490  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.15 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1692  hypothetical protein  32.65 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  40.65 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1636  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.65 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3492  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.43 
 
 		 491 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0309662  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4841  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.83 
 
 		 342 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0339142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.11 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01389  cell cycle protein MesJ  33.45 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.683525  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.87 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0918  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.49 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1467  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.83 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0235653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.5 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  37.86 
 
 		 425 aa  100  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  40.31 
 
 		 442 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.5 
 
 		 414 aa  100  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3197  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.04 
 
 		 492 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.94 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  34.96 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.33 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2892  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.85 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0294  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.38 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212762 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.04 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1442  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.11 
 
 		 440 aa  97.8  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0977  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.93 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1170  putative cell cycle protein  46.45 
 
 		 462 aa  96.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1608  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.94 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4169  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.94 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1011  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.49 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.258759  normal  0.14023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1834  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.05 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1163  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.86 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114234  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1466  Fis family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.39 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1980  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.9 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.31 
 
 		 334 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5309  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.5 
 
 		 347 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.52 
 
 		 358 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002764  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.16 
 
 		 436 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3415  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.9 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0192  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.43 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1551  cell cycle protein mesJ, putative  32.01 
 
 		 455 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1497  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.79 
 
 		 491 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3036  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.97 
 
 		 440 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.43 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1461  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.79 
 
 		 491 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2678  cell cycle protein mesJ  40.1 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0688879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2593  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.1 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3159  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.1 
 
 		 489 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1653  cell cycle protein mesJ  40.1 
 
 		 489 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000820354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1429  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.1 
 
 		 489 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2156  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.1 
 
 		 489 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  39.15 
 
 		 324 aa  93.2  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1105  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.98 
 
 		 472 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340413  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2886  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.79 
 
 		 496 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664509  normal  0.0502291 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31371  predicted protein  27.53 
 
 		 484 aa  93.2  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3168  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.74 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.07 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1364  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.67 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.84 
 
 		 321 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0199  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.36 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.25 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3265  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.08 
 
 		 470 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.867953  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1031  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.48 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.96 
 
 		 464 aa  92.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3417  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.48 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2542  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.6 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.9 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>