More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1079 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  100 
 
 		 610 aa  1192    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  55.96 
 
 		 597 aa  609  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  56.13 
 
 		 616 aa  596  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  51.07 
 
 		 626 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  52.48 
 
 		 624 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  57.71 
 
 		 598 aa  555  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  52.36 
 
 		 624 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  45.94 
 
 		 574 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  46.15 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  43.28 
 
 		 598 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  41.46 
 
 		 597 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  42.04 
 
 		 596 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  42.37 
 
 		 597 aa  415  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  41.74 
 
 		 597 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  43.44 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  42.61 
 
 		 597 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  43.4 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  43.83 
 
 		 597 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  42.56 
 
 		 570 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  40.07 
 
 		 608 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  42.94 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  40.92 
 
 		 576 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  43.05 
 
 		 572 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  40.92 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  38.51 
 
 		 573 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.15 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  39.49 
 
 		 580 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  43.03 
 
 		 580 aa  362  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  39.96 
 
 		 581 aa  360  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  39.83 
 
 		 580 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  40 
 
 		 580 aa  360  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.1 
 
 		 578 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  39.66 
 
 		 580 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  39.66 
 
 		 580 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  38.06 
 
 		 575 aa  357  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  38.06 
 
 		 575 aa  357  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  39.15 
 
 		 580 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  39.76 
 
 		 577 aa  356  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  40.17 
 
 		 580 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  41.23 
 
 		 574 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  39.56 
 
 		 576 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  39.75 
 
 		 576 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  39.56 
 
 		 576 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  39.56 
 
 		 576 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  38.8 
 
 		 577 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  38.8 
 
 		 577 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  38.8 
 
 		 577 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  39.04 
 
 		 574 aa  350  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  39.04 
 
 		 574 aa  350  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  38.8 
 
 		 577 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  38.63 
 
 		 577 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  37.97 
 
 		 574 aa  346  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  40.52 
 
 		 581 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  38.1 
 
 		 574 aa  343  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  38.9 
 
 		 574 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  41.44 
 
 		 569 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  39.15 
 
 		 582 aa  336  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  39.72 
 
 		 605 aa  336  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  39.49 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  40.7 
 
 		 538 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  39.3 
 
 		 578 aa  327  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  39.3 
 
 		 578 aa  327  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  39.3 
 
 		 578 aa  327  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  39.3 
 
 		 578 aa  327  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  39.12 
 
 		 578 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  39.12 
 
 		 578 aa  325  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  39.12 
 
 		 578 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  39.12 
 
 		 578 aa  325  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  38.95 
 
 		 541 aa  325  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  39.12 
 
 		 578 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  36.77 
 
 		 596 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  36.85 
 
 		 590 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  46.02 
 
 		 414 aa  286  9e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2517  potassium/proton antiporter  35.95 
 
 		 590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  41.28 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  44.4 
 
 		 490 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  40.09 
 
 		 486 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  44.19 
 
 		 490 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  44.5 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  44.4 
 
 		 490 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  44.41 
 
 		 485 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  36.97 
 
 		 487 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  36.88 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  38.24 
 
 		 509 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  36.27 
 
 		 498 aa  253  7e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  40.57 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  34.21 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  34.57 
 
 		 506 aa  246  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  42.2 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  37.63 
 
 		 481 aa  240  5.999999999999999e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  34.01 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0927  sodium/hydrogen exchanger  40.93 
 
 		 492 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  37.01 
 
 		 492 aa  231  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  32.42 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  45.3 
 
 		 411 aa  227  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  39.62 
 
 		 491 aa  224  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  35.02 
 
 		 498 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  35.73 
 
 		 496 aa  216  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 		 527 aa  212  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>