More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1059 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  100 
 
 
327 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  61.04 
 
 
328 aa  374  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  59.82 
 
 
328 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  60.43 
 
 
328 aa  358  9e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  56.1 
 
 
328 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  55.66 
 
 
327 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  52.89 
 
 
330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  52.13 
 
 
328 aa  338  9e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  53.17 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  54.49 
 
 
340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  55.81 
 
 
324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  52.74 
 
 
328 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  54.13 
 
 
360 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  51.98 
 
 
330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  52.28 
 
 
331 aa  328  9e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  52.89 
 
 
330 aa  328  9e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  54.09 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  50.94 
 
 
317 aa  326  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
328 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  54.69 
 
 
332 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  51.06 
 
 
328 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  51.21 
 
 
331 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.91 
 
 
331 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  51.37 
 
 
330 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  52.2 
 
 
327 aa  322  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  51.68 
 
 
491 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  55.21 
 
 
332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  52.6 
 
 
329 aa  318  7e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  53.66 
 
 
329 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
331 aa  315  8e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  54.98 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  50.63 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  53.05 
 
 
329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  52.01 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  52.27 
 
 
330 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  50 
 
 
335 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  56.15 
 
 
329 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  50.76 
 
 
326 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  53.33 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4943  aldo/keto reductase  55.08 
 
 
333 aa  308  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020989  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  50.3 
 
 
328 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  51.23 
 
 
331 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  51.99 
 
 
328 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  51.91 
 
 
320 aa  305  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  51.17 
 
 
325 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  52.41 
 
 
334 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  51.46 
 
 
449 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  52.27 
 
 
324 aa  299  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  50.76 
 
 
333 aa  298  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  50.62 
 
 
330 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  51.85 
 
 
331 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  54.92 
 
 
327 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  52.37 
 
 
328 aa  295  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  53.45 
 
 
328 aa  295  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  48.02 
 
 
333 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  52.13 
 
 
331 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  48.76 
 
 
331 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  45.09 
 
 
328 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
335 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  47.56 
 
 
327 aa  292  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  48.9 
 
 
329 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.92 
 
 
329 aa  291  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  46.75 
 
 
326 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.5 
 
 
329 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  51.5 
 
 
329 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.5 
 
 
329 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2093  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
322 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461089  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  51.22 
 
 
331 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  53.23 
 
 
328 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  50.78 
 
 
325 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  52.75 
 
 
325 aa  289  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  51.97 
 
 
309 aa  288  8e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  48.31 
 
 
331 aa  287  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  52.49 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2669  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
334 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000580906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  52.74 
 
 
324 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  48.01 
 
 
334 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  46.81 
 
 
331 aa  285  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  48.32 
 
 
334 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  49.06 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  48.47 
 
 
331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  48.62 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  47.56 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  47.35 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  48.12 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.24 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  50.66 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  48.12 
 
 
329 aa  281  9e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  48.76 
 
 
320 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  51.24 
 
 
330 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3748  aldo/keto reductase  51.71 
 
 
317 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  47.34 
 
 
329 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  54.21 
 
 
330 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  46.95 
 
 
327 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
330 aa  279  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  47.83 
 
 
334 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  46.37 
 
 
327 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>