More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1005 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 344 aa  706    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  51.96 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  48.06 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  51.96 
 
 		 314 aa  333  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  53.07 
 
 		 314 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.37 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  53.72 
 
 		 329 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  53.4 
 
 		 316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  53.59 
 
 		 318 aa  325  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  49.53 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  49.04 
 
 		 320 aa  319  5e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  48.92 
 
 		 342 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  48.73 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  49.35 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  44.87 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  45.19 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  45.98 
 
 		 321 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  47.37 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  47.78 
 
 		 337 aa  298  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 334 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  42.12 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  46.79 
 
 		 336 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  46.79 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  47.16 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  43.95 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  42.61 
 
 		 568 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  45.71 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  42.63 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  43.69 
 
 		 341 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  45.69 
 
 		 329 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  41.69 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.71 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  46.71 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  42.45 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  44.9 
 
 		 310 aa  278  7e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  48.14 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  49.2 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  43.73 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  44.11 
 
 		 358 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  42.98 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  43.31 
 
 		 313 aa  268  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  42.9 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  44.34 
 
 		 336 aa  266  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  43.58 
 
 		 398 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  42.77 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  43.09 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  42.12 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  41.07 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  40.57 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  40.84 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  36.39 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  40.82 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 		 319 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  36.5 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  36.39 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  38.94 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  38.93 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  38.22 
 
 		 331 aa  219  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  41.96 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  37 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  37.75 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.7 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  40.49 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  36.77 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  35.33 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  34.67 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 234 aa  185  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  39.13 
 
 		 237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.9 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.24 
 
 		 335 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.24 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.24 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.24 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.24 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.24 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.24 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.24 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0925  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.64 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.937263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 		 243 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.96 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>