32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0973 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0973  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  283  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0086355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2247  hypothetical protein  65.38 
 
 		 133 aa  167  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3836  hypothetical protein  55.47 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.242387  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34640  hypothetical protein  68.13 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0837  hypothetical protein  65.26 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.05984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2465  hypothetical protein  67.03 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.705928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2196  hypothetical protein  67.44 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.250793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3831  hypothetical protein  62.64 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0747  hypothetical protein  63.04 
 
 		 99 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000864185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0644  hypothetical protein  63.04 
 
 		 99 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0602249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1935  hypothetical protein  56.52 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.157401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1968  hypothetical protein  50.43 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.426641  normal  0.147802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0484  hypothetical protein  61.54 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4283  hypothetical protein  56.25 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2049  hypothetical protein  59.34 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2128  hypothetical protein  57.14 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70369  normal  0.722848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0347  hypothetical protein  59.18 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0420  hypothetical protein  56.38 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.3293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2347  hypothetical protein  59.14 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.307924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1981  hypothetical protein  59.14 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.11308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0141  hypothetical protein  53.27 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4140  hypothetical protein  55.32 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0143  hypothetical protein  53.27 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4271  hypothetical protein  53.68 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4293  hypothetical protein  53.68 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15960  hypothetical protein  48 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0003  hypothetical protein  53.49 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000143416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1762  hypothetical protein  45 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0762473  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2143  hypothetical protein  60.29 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00966347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7257  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  37.8 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  36.23 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>