191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0961 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.1 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  40.87 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  41.67 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.67 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.48 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  42.06 
 
 		 245 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.41 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0737  heat shock protein DnaJ domain protein  44.55 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1731  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.19 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1445  DnaJ domain-containing protein  43.72 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0302292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1401  DnaJ domain-containing protein  43.72 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.382181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.73 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.42 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  46.27 
 
 		 235 aa  172  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1897  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.33 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.394264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0785  putative heat shock protein DnaJ  39.69 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  44.13 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.69 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525604  hitchhiker  0.00758559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2105  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.27 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  41.55 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  37.21 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2019  heat shock protein DnaJ-like  46.94 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37079  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.45 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1801  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.92 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1139  heat shock protein DnaJ domain protein  42.12 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.05 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2608  heat shock protein DnaJ domain protein  36.19 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.66 
 
 		 251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  29.3 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.67 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  28.68 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  31.77 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  32.49 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  29.43 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  31.75 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  31.75 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  28.21 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  27.84 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  28.03 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  30.1 
 
 		 288 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  28.1 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  28.94 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  28.1 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.92 
 
 		 267 aa  99  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  27.3 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  28.57 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  29.76 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  30.31 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  27.86 
 
 		 270 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  27.86 
 
 		 271 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  27.47 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  28.4 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  28.4 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  28.74 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.68 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  26.6 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  26.6 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  26.6 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  26.6 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  26.6 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  26.6 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  26.24 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  29.71 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  26.6 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  26.33 
 
 		 270 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  26.33 
 
 		 270 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  26.33 
 
 		 270 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  26.33 
 
 		 270 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  26.33 
 
 		 270 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  27.18 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  27.18 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  26.24 
 
 		 271 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  26.6 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  29.27 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  27.18 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  26.19 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  26.19 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.41 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  28.82 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  25.7 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  30.2 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  30.67 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  26.7 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  27.33 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  27.27 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  24.9 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  26.6 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  24.67 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  25.66 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  24.64 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  26.12 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  27.68 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.37 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  25.46 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  25.37 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  25.49 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  24.49 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  25.33 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  44.62 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>