More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0888 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  423  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
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NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  31.09 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.67 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  26.52 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
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NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  22.99 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
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NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  23.68 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  23.5 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
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NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  25.14 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  24.73 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  27.41 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
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NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
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