66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0832 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  67.76 
 
 		 216 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  53.96 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  56.76 
 
 		 199 aa  207  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  47.78 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  50 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.51 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  51.34 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.65 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  53.85 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  45.89 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  48.19 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  43.87 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  47.85 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  44.27 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  43.84 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.37 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  38.53 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  42.21 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40.48 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.21 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  40 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  39 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  45.32 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  42.13 
 
 		 214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  41.12 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  38.79 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  45.6 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.5 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.05 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  40.1 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.19 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  35.71 
 
 		 194 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.22 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  36.7 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.57 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  35 
 
 		 553 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.07 
 
 		 544 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.57 
 
 		 559 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  31.22 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.68 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.53 
 
 		 570 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  32.64 
 
 		 196 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  34.36 
 
 		 545 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  30.57 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  30.57 
 
 		 196 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.77 
 
 		 550 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  30.61 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  34.52 
 
 		 598 aa  82.8  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.16 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  27.96 
 
 		 594 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.56 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  26.74 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.39 
 
 		 580 aa  55.8  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.08 
 
 		 558 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  31.62 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  29.55 
 
 		 170 aa  52  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  32.06 
 
 		 170 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.47 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.4 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  33.59 
 
 		 170 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.13 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  32.26 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  25.19 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.36 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.9 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>