249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0661 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0661  Hly-III related proteins  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3388  Hly-III related proteins  44.98 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0217913  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  43.69 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1889  Hly-III family protein  43.69 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.582334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5366  Hly-III family protein  44.86 
 
 		 230 aa  151  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  42.08 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5862  Hly-III family protein  47.91 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  42.72 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  41.58 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  41.09 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1271  Hemolysin III  43.35 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  41.38 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  41.58 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  46.31 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  38.76 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0605  Hly-III family protein  42.08 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  41.83 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  39.9 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  36.1 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  40.39 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  37.26 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4269  Hly-III related proteins  40.3 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673544  normal  0.633803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0995  Hly-III family protein  39.51 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3940  Hly-III related proteins  40.87 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  37.26 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0867  Hly-III family protein  39.02 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296032  normal  0.935947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  37.56 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3701  Hly-III related proteins  41.06 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  37.44 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  37.44 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  37.44 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  37.44 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  37.44 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  37.44 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  37.44 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  38.73 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  37.44 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  37.44 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1262  Hly-III family protein  40.89 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  37.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  37.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  37.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  37.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  37.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  37.44 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  38.61 
 
 		 241 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  36.41 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1879  hemolysin III family channel protein  41.58 
 
 		 227 aa  131  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  33.33 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  38.73 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2447  hemolysin III family channel protein  40.59 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0078  Hly-III family protein  38.24 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0068  hemolysin III family channel protein  38.24 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  38.61 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2099  hemolysin III family channel protein  40.59 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1934  hemolysin III family channel protein  39.6 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.680237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  37.44 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  39.51 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  39.51 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4657  Hly-III family protein  39.34 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  39.51 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  40.39 
 
 		 221 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0525  hypothetical protein  38.61 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2177  Hly-III family protein  38.61 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00438954  normal  0.0630884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  38.24 
 
 		 236 aa  124  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  36.95 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  34.98 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  39.59 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6673  hemolysin III  36.54 
 
 		 231 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  33.17 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  35.12 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  33.66 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  36.54 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  34.48 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  33 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  35.96 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03334  hemolysin III  38.42 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  38.78 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  35.78 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  33.17 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  35.82 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  35.47 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  34.48 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0547  Hly-III related proteins  38.65 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  37.44 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  36.63 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  36.36 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0904  Hly-III family protein  39.49 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  34 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  34 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  33.83 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2910  hypothetical protein  39.62 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44801  normal  0.495918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  34.48 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  33.5 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  35.38 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  33.5 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  33.5 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  35.38 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  40.25 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  33.5 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>