167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0642 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  717    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  51.25 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  47.85 
 
 		 375 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  47.59 
 
 		 390 aa  288  8e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  50.57 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  45.61 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  46.05 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  45.73 
 
 		 376 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  49.05 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  43.92 
 
 		 376 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  44 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  42.22 
 
 		 366 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  41.94 
 
 		 366 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  43.49 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  45.79 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  40.72 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  43.61 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  45.85 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  51.52 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  41.76 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  45.56 
 
 		 357 aa  252  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  43.23 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  45.19 
 
 		 356 aa  248  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  42.14 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  47.98 
 
 		 339 aa  245  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  39.73 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  45.8 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  39.45 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  46.92 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  49.05 
 
 		 356 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  46.11 
 
 		 351 aa  239  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  35.59 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  46.81 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  47.11 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  42.77 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  44.19 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  49.56 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  48.29 
 
 		 361 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  49.26 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  49.01 
 
 		 351 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  35.99 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  33.73 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  32.63 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  34.56 
 
 		 449 aa  209  6e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  39.39 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  34.64 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  30.87 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  29.03 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  33.24 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  33.5 
 
 		 393 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.39 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  34.55 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  35.97 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  34.71 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  35.01 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  34.26 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  30.73 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  32.23 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  34.95 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  33.96 
 
 		 394 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  32.32 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  33.23 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  33.73 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  29.06 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  29.06 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  32.73 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  35.81 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  31.01 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  32.95 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  32.04 
 
 		 387 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  32.89 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  34.15 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  32 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  30.1 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  29.27 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  32.92 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  30.53 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  31.45 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  29.59 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  29.32 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  35.47 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  35.47 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  34.14 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  34.14 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  34.14 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  34.14 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  34.14 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  32.21 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  31.23 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  32.45 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  30.68 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  29.68 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  30.24 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.09 
 
 		 404 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  32.26 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  34.85 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  35.56 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  30.97 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  32.53 
 
 		 396 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>