More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0632 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
736 aa  1470    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
559 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.15 
 
 
563 aa  363  9e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 
567 aa  361  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.93 
 
 
563 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 
573 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 
561 aa  345  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.15 
 
 
562 aa  331  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 
567 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 
565 aa  318  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.7 
 
 
586 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 
560 aa  311  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 
608 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.28 
 
 
558 aa  300  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.39 
 
 
561 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 
559 aa  298  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  33.86 
 
 
661 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  36.95 
 
 
566 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.07 
 
 
575 aa  294  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
565 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.07 
 
 
558 aa  290  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  36.14 
 
 
661 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 
561 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 
579 aa  282  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  35.49 
 
 
565 aa  276  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 
561 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1109  chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 
566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  46.24 
 
 
563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.22 
 
 
560 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.56 
 
 
567 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.33 
 
 
562 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 
561 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
561 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1584  chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 
556 aa  260  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 
562 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.69 
 
 
563 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.39 
 
 
672 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
711 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  46.61 
 
 
669 aa  256  9e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1583  chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 
583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.105257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 
656 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.71 
 
 
694 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 
688 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.4 
 
 
533 aa  254  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  44.24 
 
 
688 aa  254  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  42.2 
 
 
561 aa  254  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  45.6 
 
 
568 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.89 
 
 
563 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
561 aa  249  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
691 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.26 
 
 
688 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
563 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 
563 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.73 
 
 
561 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 
712 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.74 
 
 
655 aa  248  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.41 
 
 
689 aa  248  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
674 aa  247  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.15 
 
 
567 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
674 aa  246  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.07 
 
 
563 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  43.32 
 
 
565 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
655 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 
563 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.19 
 
 
691 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.51 
 
 
673 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.93 
 
 
561 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  42.2 
 
 
688 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.17 
 
 
553 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  44.33 
 
 
602 aa  245  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
656 aa  245  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 
712 aa  244  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.66 
 
 
712 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  31.7 
 
 
549 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 
561 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 
644 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.52 
 
 
566 aa  242  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.71 
 
 
563 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 
566 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.58 
 
 
563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.685315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 
549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.482626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.37 
 
 
572 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.89 
 
 
560 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 
656 aa  240  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
561 aa  240  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.12 
 
 
566 aa  240  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  42.06 
 
 
561 aa  240  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0568  chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 
662 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  40.36 
 
 
565 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.5 
 
 
675 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.36 
 
 
688 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.18 
 
 
562 aa  238  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 
566 aa  238  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.72 
 
 
561 aa  237  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  43.5 
 
 
688 aa  236  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 
568 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  42.13 
 
 
566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
689 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
564 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>