More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0607 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 171 aa  343  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  68.42 
 
 		 171 aa  243  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 		 180 aa  231  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  53.16 
 
 		 424 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 172 aa  169  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  168  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 172 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 172 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 175 aa  162  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 173 aa  161  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 172 aa  161  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 172 aa  161  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  160  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1684  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 190 aa  160  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0340308  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 174 aa  158  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09083  adenine phosphoribosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_7G02310)  44.44 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000528084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 		 174 aa  154  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 		 172 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 		 172 aa  154  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 		 170 aa  153  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 170 aa  152  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  45.66 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 		 175 aa  151  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  47.47 
 
 		 170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 181 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1819  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 170 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0215427  normal  0.463714 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf610  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.107606  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1400  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 175 aa  148  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 178 aa  147  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0435  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 184 aa  147  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 		 181 aa  147  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>