More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0601 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
248 aa  513  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  76.21 
 
 
293 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  78.69 
 
 
291 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1074  phosphate transporter ATP-binding protein  79.1 
 
 
247 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566041  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1541  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  76.61 
 
 
265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871214  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  73.79 
 
 
264 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0489  phosphate transporter ATP-binding protein  76.21 
 
 
271 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  75.81 
 
 
284 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1231  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  75.81 
 
 
281 aa  400  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.758755 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0768  phosphate transporter ATP-binding protein  77.82 
 
 
273 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0255819  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  73.79 
 
 
265 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2406  ABC phosphate transporter ATP-binding protein  73.79 
 
 
275 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3626  phosphate transporter ATP-binding protein  73.98 
 
 
295 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.926867  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0122  phosphate transporter ATP-binding protein  74.6 
 
 
271 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.341225 
 
 
-
 
NC_004310  BR2141  phosphate transporter ATP-binding protein  77.78 
 
 
257 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2056  phosphate transporter ATP-binding protein  77.78 
 
 
257 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12029  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0171  phosphate transporter ATP-binding protein  74.6 
 
 
271 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0181  phosphate transporter ATP-binding protein  74.6 
 
 
271 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  72.58 
 
 
265 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1922  phosphate transporter ATP-binding protein  72.98 
 
 
265 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  71.37 
 
 
265 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  72.58 
 
 
265 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  74.59 
 
 
302 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  75 
 
 
275 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3315  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.18 
 
 
290 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0283925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  73.79 
 
 
260 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2292  phosphate transporter ATP-binding protein  67.05 
 
 
283 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1225  phosphate transporter ATP-binding protein  71.77 
 
 
252 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315326  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  73.36 
 
 
263 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.82 
 
 
273 aa  351  5e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.71 
 
 
254 aa  347  7e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.11 
 
 
276 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.67 
 
 
253 aa  346  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  66.26 
 
 
285 aa  345  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  66.53 
 
 
261 aa  345  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  66.13 
 
 
277 aa  344  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  66.13 
 
 
277 aa  344  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 
251 aa  343  2e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  64.92 
 
 
277 aa  340  9e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  61.69 
 
 
253 aa  340  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 
258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  63.01 
 
 
260 aa  338  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
285 aa  338  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  64.52 
 
 
284 aa  338  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  65.32 
 
 
253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  65.04 
 
 
249 aa  337  7e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 
249 aa  337  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.31 
 
 
252 aa  337  8e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.8 
 
 
292 aa  337  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.11 
 
 
254 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  64.11 
 
 
252 aa  337  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.63 
 
 
253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 
251 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  64.11 
 
 
277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 
253 aa  335  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05140  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.63 
 
 
249 aa  335  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.69 
 
 
251 aa  335  5e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.7 
 
 
252 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 
276 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.71 
 
 
251 aa  333  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  64.52 
 
 
255 aa  333  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 
253 aa  333  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 
253 aa  333  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4289  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.82 
 
 
249 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 
251 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.29 
 
 
251 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  64.11 
 
 
251 aa  333  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 
256 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  63.82 
 
 
277 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  64.11 
 
 
262 aa  332  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.3 
 
 
269 aa  332  5e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.23 
 
 
251 aa  331  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  64.11 
 
 
262 aa  331  8e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 
262 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  61.29 
 
 
254 aa  330  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  63.31 
 
 
252 aa  329  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.71 
 
 
252 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 
279 aa  329  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  62.2 
 
 
255 aa  329  3e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.96 
 
 
255 aa  329  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  62.1 
 
 
272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  63.82 
 
 
277 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  63.82 
 
 
277 aa  327  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 
260 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.48 
 
 
251 aa  327  8e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  63.82 
 
 
281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  60.08 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  63.82 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.87 
 
 
260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4231  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 
277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1242  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.73 
 
 
286 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.867725  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2808  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.38 
 
 
265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
272 aa  326  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.51 
 
 
286 aa  326  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>