More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0514 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 367 aa  721    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.87 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  57.88 
 
 		 348 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.01 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  50.27 
 
 		 384 aa  334  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.2 
 
 		 358 aa  332  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.91 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.96 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.87 
 
 		 362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.56 
 
 		 358 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.27 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 364 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 364 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.17 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.58 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.71 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.21 
 
 		 358 aa  316  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.01 
 
 		 348 aa  316  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.15 
 
 		 356 aa  316  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.43 
 
 		 364 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.45 
 
 		 364 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.44 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  46.87 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.09 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.96 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.25 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.25 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 		 364 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 364 aa  308  9e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  50.7 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.29 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.56 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  51.42 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.4 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  51.25 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.57 
 
 		 362 aa  302  6.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 362 aa  301  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.55 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.42 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.7 
 
 		 357 aa  299  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 		 361 aa  298  8e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.88 
 
 		 348 aa  298  9e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  49 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.7 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  50.7 
 
 		 367 aa  296  5e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.8 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  50.96 
 
 		 363 aa  292  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  50.96 
 
 		 363 aa  292  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.71 
 
 		 351 aa  292  7e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  50.87 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  49.55 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.23 
 
 		 354 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.79 
 
 		 355 aa  288  8e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.7 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.7 
 
 		 352 aa  285  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.86 
 
 		 351 aa  285  8e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  44.35 
 
 		 348 aa  285  9e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.86 
 
 		 351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.05 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.03 
 
 		 352 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  48.02 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 377 aa  279  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.55 
 
 		 347 aa  279  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  52.35 
 
 		 370 aa  278  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  46.91 
 
 		 355 aa  278  9e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.87 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  47.15 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.58 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  47.98 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 343 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 339 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.89 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.56 
 
 		 375 aa  276  5e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.41 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.67 
 
 		 348 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.05 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1724  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.58 
 
 		 351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  45.8 
 
 		 348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  52.06 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.38 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  44.08 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  45.66 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.58 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.8 
 
 		 351 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.59 
 
 		 336 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  45.94 
 
 		 356 aa  272  5.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 340 aa  272  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  46.97 
 
 		 344 aa  272  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.48 
 
 		 342 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.29 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.29 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>