227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0478 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  100 
 
 		 448 aa  934    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 486 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 447 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 454 aa  167  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 454 aa  167  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 449 aa  149  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 442 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 442 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 477 aa  136  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.02 
 
 		 483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 447 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 449 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  22.36 
 
 		 450 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  25.29 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 455 aa  113  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  26.48 
 
 		 329 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 454 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.93 
 
 		 432 aa  93.2  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  23.06 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 443 aa  87  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  22.16 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  21.71 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  21.79 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  21.2 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  21.68 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  20.9 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  21.74 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  22.7 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  23.76 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  21.41 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  20.89 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  22.74 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  21.37 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  20.88 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  18.93 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.22 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  21.3 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  21.68 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  20.9 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  21.68 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  23.08 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  23.08 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 385 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  22.85 
 
 		 388 aa  54.3  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 365 aa  53.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 402 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 518 aa  53.1  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 452 aa  53.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 394 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 1002 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>