More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0454 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
500 aa  1004    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  58.15 
 
 
497 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  54.93 
 
 
500 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  56.63 
 
 
499 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  54.73 
 
 
497 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  58.28 
 
 
493 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  54.44 
 
 
497 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  54.78 
 
 
500 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  57.68 
 
 
496 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  54.64 
 
 
495 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  54.42 
 
 
496 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  56.41 
 
 
514 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  53.92 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  53.78 
 
 
497 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  55.13 
 
 
500 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  55.8 
 
 
498 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  52.21 
 
 
498 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  55.8 
 
 
499 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  53.32 
 
 
500 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  52.62 
 
 
487 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  54.56 
 
 
539 aa  471  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  50.94 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  52.08 
 
 
542 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  54.24 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  47.24 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  50.61 
 
 
503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  57.01 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  52.58 
 
 
497 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  49.6 
 
 
489 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  52.68 
 
 
488 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  54.34 
 
 
489 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  52.28 
 
 
500 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  52.35 
 
 
497 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  53.2 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  53.93 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  47.45 
 
 
500 aa  435  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  47.46 
 
 
500 aa  430  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  56.28 
 
 
485 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  48.8 
 
 
488 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  47.91 
 
 
497 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  50.41 
 
 
489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  50.41 
 
 
489 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  51.23 
 
 
491 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  44.57 
 
 
506 aa  381  1e-104  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  43.89 
 
 
492 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  44.62 
 
 
510 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  44.62 
 
 
510 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  44.62 
 
 
510 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  41.75 
 
 
496 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  44.39 
 
 
510 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  46.32 
 
 
508 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  41.31 
 
 
506 aa  361  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  42.86 
 
 
496 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  49.8 
 
 
533 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  42.8 
 
 
496 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  43.95 
 
 
511 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  43.95 
 
 
511 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  43.95 
 
 
511 aa  359  8e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  43.78 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  43.72 
 
 
518 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  44.12 
 
 
515 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  43.23 
 
 
496 aa  355  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  40.54 
 
 
493 aa  355  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  42.19 
 
 
496 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  42.61 
 
 
512 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  42.97 
 
 
496 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  42.71 
 
 
495 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  43.95 
 
 
511 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  42.59 
 
 
497 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  42.38 
 
 
497 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  40.84 
 
 
501 aa  349  8e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 
518 aa  348  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  42.51 
 
 
495 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 
487 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  45.6 
 
 
488 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 
508 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  41.96 
 
 
497 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  41.94 
 
 
497 aa  345  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  41.96 
 
 
497 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  43.94 
 
 
508 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  43.76 
 
 
503 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  46.49 
 
 
496 aa  343  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  42.92 
 
 
503 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  41.85 
 
 
496 aa  342  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  46.24 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  40.28 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  41.56 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  43.03 
 
 
503 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  43.03 
 
 
503 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  42.83 
 
 
503 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  41.56 
 
 
503 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2408  PepA aminopeptidase  43.89 
 
 
507 aa  336  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729851  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2169  leucyl aminopeptidase  46.57 
 
 
510 aa  336  7e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  41.77 
 
 
503 aa  336  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  43.03 
 
 
503 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  43.03 
 
 
503 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  43.03 
 
 
503 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  42.16 
 
 
503 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  43.03 
 
 
503 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 
503 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>