97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0448 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  54.65 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  50.56 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  52.43 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  45.56 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  45.56 
 
 		 447 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  52.65 
 
 		 274 aa  244  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  52.71 
 
 		 464 aa  238  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  51.74 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  49.43 
 
 		 267 aa  235  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  48.85 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  46.59 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  42.91 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  42.69 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  40.29 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  42.53 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  39.7 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  42.32 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  41.42 
 
 		 481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  45.53 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  39.92 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  38.24 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  34.08 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  39.85 
 
 		 484 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  34.34 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  37.01 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  29.5 
 
 		 262 aa  136  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  35.87 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  31.09 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  37.09 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  33.21 
 
 		 522 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  34.88 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  36.79 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  39.19 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  29.56 
 
 		 275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  33.57 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  32.62 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  34.07 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  37.04 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  32.37 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  33.09 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  32.84 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  29.58 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  32.61 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  31.65 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  30.36 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  29.02 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  30.45 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  32.27 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  34.89 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  32.48 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  31.27 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  29.62 
 
 		 282 aa  109  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  34.78 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  33.45 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  33.57 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  28.11 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  27.76 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  34.41 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  34.35 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  32.6 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  30.15 
 
 		 438 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  25.47 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  37.36 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  27.05 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  32.73 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  35.26 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  29.52 
 
 		 438 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  32.96 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  29.74 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  29.23 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  28.17 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  32.45 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  37.44 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  30.91 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  28.68 
 
 		 438 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  30.77 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  31.06 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  29.74 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  25.84 
 
 		 262 aa  89.4  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  28.22 
 
 		 356 aa  85.5  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  37.84 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  36.9 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  36.16 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  31.05 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  31.73 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3629  hypothetical protein  32.67 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  32.08 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0526  dioxygenase-like protein  39.38 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.579832  normal  0.413841 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36516  predicted protein  25.94 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  30.69 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  31.25 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  31.56 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3451  protein of unknown function DUF52  32.14 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3308  hypothetical protein  31.63 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3387  protein of unknown function DUF52  29.38 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0075  hypothetical protein  29.19 
 
 		 414 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>