More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0393 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 151 aa  299  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  78.79 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  78.79 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 		 132 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  75 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  72.31 
 
 		 136 aa  202  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  73.48 
 
 		 132 aa  202  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  73.68 
 
 		 137 aa  200  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  73.68 
 
 		 142 aa  200  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  71.21 
 
 		 132 aa  197  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  71.43 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  71.21 
 
 		 133 aa  193  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  70.99 
 
 		 135 aa  191  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  70.31 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  70 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  73.17 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  68.42 
 
 		 138 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  70.77 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  70 
 
 		 135 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  66.92 
 
 		 137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  68.94 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  68.46 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  68.46 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  67.42 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  65.69 
 
 		 347 aa  184  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  66.42 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  66.92 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  65.65 
 
 		 134 aa  178  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  66.92 
 
 		 334 aa  176  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  71.79 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  70 
 
 		 135 aa  174  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  72.65 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  69.17 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  69.23 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  69.23 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  60.31 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  60.83 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  65.81 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  57.6 
 
 		 135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  60.32 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  53.28 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  47.24 
 
 		 318 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  44.17 
 
 		 302 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  46.22 
 
 		 312 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  44.12 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  44.27 
 
 		 142 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  50.45 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.97 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.15 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.15 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.15 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  45.83 
 
 		 315 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  45.08 
 
 		 313 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.53 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  44.17 
 
 		 314 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.34 
 
 		 138 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.94 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  36.59 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  40.97 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  38.71 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  38.21 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  43.33 
 
 		 315 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.94 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  42.55 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  41.94 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.94 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  38.21 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  44.35 
 
 		 316 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  43.51 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.94 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  43.55 
 
 		 317 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  42.19 
 
 		 310 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  43.33 
 
 		 313 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  37.4 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  43.31 
 
 		 320 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  34.88 
 
 		 363 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  42.28 
 
 		 314 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  43.31 
 
 		 320 aa  91.3  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  41.67 
 
 		 316 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  41.53 
 
 		 317 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>