12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0383 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0383  SH3 domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  248  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2534  Variant SH3 domain protein  51.33 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3400  SH3 domain-containing protein  43.48 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3378  SH3 domain protein  42.61 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3571  SH3 domain-containing protein  42.11 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541484  normal  0.671708 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3074  hypothetical protein  41.74 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3404  SH3 domain protein  41.74 
 
 		 113 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0826  SH3 domain-containing protein  33.91 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.640875  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3748  Variant SH3 domain protein  34.23 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3548  SH3 domain-containing protein  26.72 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04226  variant SH3 domain protein  30.1 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00630  SH3 domain-containing protein  33.05 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>