More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0271 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  75.65 
 
 		 212 aa  310  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  71.05 
 
 		 205 aa  298  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  70.9 
 
 		 212 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  71.12 
 
 		 212 aa  295  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  68.42 
 
 		 242 aa  294  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  68.42 
 
 		 236 aa  294  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  68.42 
 
 		 292 aa  294  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  68.42 
 
 		 292 aa  294  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  68.42 
 
 		 292 aa  294  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  68.42 
 
 		 292 aa  294  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  68.42 
 
 		 292 aa  294  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  70.16 
 
 		 206 aa  292  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  69.15 
 
 		 258 aa  290  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  68.62 
 
 		 209 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  68.09 
 
 		 209 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  68.62 
 
 		 210 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  68.09 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  67.69 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  68.09 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  68.28 
 
 		 209 aa  288  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  67.55 
 
 		 211 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  67.55 
 
 		 209 aa  287  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  68.31 
 
 		 203 aa  271  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  67.76 
 
 		 203 aa  268  7e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  65.96 
 
 		 203 aa  265  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  67.21 
 
 		 190 aa  264  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  63.16 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  66.3 
 
 		 190 aa  260  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  61.83 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  62.37 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  61.26 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  60.33 
 
 		 206 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  60.73 
 
 		 219 aa  244  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  58.03 
 
 		 222 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  61.88 
 
 		 197 aa  241  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 213 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 		 269 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 		 269 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  63.13 
 
 		 206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  65.54 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  63.54 
 
 		 192 aa  236  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  57.75 
 
 		 201 aa  235  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  60.54 
 
 		 204 aa  234  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  53.14 
 
 		 213 aa  234  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  62.3 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  53.65 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 205 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  57.14 
 
 		 210 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  64.6 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  63.98 
 
 		 204 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  54.84 
 
 		 213 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  54.84 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 		 206 aa  218  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 		 234 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  51.05 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  51.05 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  51.87 
 
 		 247 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  51.6 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  48.58 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  51.06 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  53.93 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  54.21 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 		 216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  54.21 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  54.14 
 
 		 201 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  54.14 
 
 		 201 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  54.14 
 
 		 201 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 190 aa  197  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 216 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  52.57 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 219 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  51.85 
 
 		 202 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 		 202 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  49.2 
 
 		 243 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  51 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  51.98 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 190 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  52.22 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  47.57 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 		 185 aa  192  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  53.63 
 
 		 186 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>