56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0257 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0257  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000425261  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3471  protein of unknown function DUF898 transmembrane  40.64 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  39.77 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  36.47 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  39.36 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1119  protein of unknown function DUF898 transmembrane  34.41 
 
 		 432 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.785224  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  36.56 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  34.99 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  34.97 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  35.06 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  34.32 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  30.73 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0643  hypothetical protein  37.65 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  34.97 
 
 		 434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  33.99 
 
 		 408 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0463  hypothetical protein  36.73 
 
 		 376 aa  166  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0184539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  33.62 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1952  hypothetical protein  30.33 
 
 		 385 aa  155  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110513  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2076  transmembrane protein  36.92 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.512785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2661  hypothetical protein  32.61 
 
 		 397 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0568  hypothetical protein  28 
 
 		 392 aa  142  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3685  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.32 
 
 		 395 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3621  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.06 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0377  hypothetical protein  26.8 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0871  hypothetical protein  30.05 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3534  hypothetical protein  29.95 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3663  hypothetical protein  29.95 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03033  hypothetical protein  27.08 
 
 		 391 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0428  protein of unknown function DUF898 transmembrane  29.1 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.749307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3533  hypothetical protein  32.53 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2154  hypothetical protein  27.92 
 
 		 411 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4879  hypothetical protein  25.71 
 
 		 395 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4730  inner membrane protein YjgN  26.6 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4823  inner membrane protein YjgN  26.55 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0791  hypothetical protein  26.67 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4760  inner membrane protein YjgN  23.59 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5226  protein of unknown function DUF898 transmembrane  23.2 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3509  hypothetical protein  27.79 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3003  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.08 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3720  hypothetical protein  31.08 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1892  hypothetical protein  30.3 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1890  hypothetical protein  46.38 
 
 		 1397 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.608701  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3755  hypothetical protein  32.9 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04123  conserved inner membrane protein  32.9 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04087  hypothetical protein  32.9 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4828  hypothetical protein  32.9 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4513  hypothetical protein  32.9 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00333203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5778  hypothetical protein  32.26 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4737  hypothetical protein  31.61 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.243262  normal  0.802179 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3740  protein of unknown function DUF898 transmembrane  32.9 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2755  membrane-like protein  25.28 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3236  hypothetical protein  26.16 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3400  hypothetical protein  25.89 
 
 		 357 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1977  hypothetical protein  27.01 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2015  hypothetical protein  30.71 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.78332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2292  protein of unknown function DUF898 transmembrane  31.39 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>