More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0236 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 129 aa  251  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  57.6 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  54.33 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  55.56 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  45.6 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  50.41 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  50.41 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  47.2 
 
 		 270 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  48.78 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  48 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 133 aa  94.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  47.01 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  46.15 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  47.12 
 
 		 228 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  43.33 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  44.92 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  43.2 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  43.2 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  47.9 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  49.54 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  49.54 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  40.83 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  40.83 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  40.98 
 
 		 122 aa  84.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  45.61 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  49.09 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  42.24 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.12 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  35.96 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1915  camphor resistance CrcB protein  38.52 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  39.34 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  38.94 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  31.15 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  39.47 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  38.33 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.29 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  36.13 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  40.48 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  41.28 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  40.2 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  35.59 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  36.13 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  38.94 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  41.28 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>