More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0216 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  330  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  72.84 
 
 		 162 aa  246  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 162 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  52.26 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  52.26 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  52.26 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  52.26 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  52.26 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 202 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  52.35 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  48.99 
 
 		 175 aa  157  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 161 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  51.57 
 
 		 229 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 153 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 175 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  51.68 
 
 		 153 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 213 aa  150  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  45.64 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 155 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  46.98 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  46.15 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  45.16 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  45.45 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.59 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 164 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  44.81 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  42 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.28 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  43.95 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.3 
 
 		 152 aa  131  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  41.4 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.4 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  41.61 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  48.08 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  41.06 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 181 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  48.99 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 152 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 153 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  40.27 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>