199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0204 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  100 
 
 		 114 aa  224  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  46.53 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  42.99 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  46.46 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  43.14 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  46.15 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  41.18 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  42.27 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  41 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  41.58 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  42.57 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  37.5 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  39.25 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  42.57 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  38.61 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  42.86 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  41.75 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  42.57 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  43.69 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  38.61 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  43.43 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  41.58 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  39.81 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  38.61 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  40.21 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  42.42 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  34.31 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  41.24 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  38.61 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  37.62 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  36.79 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  35.64 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  39.22 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  33.67 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  43.9 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  35.11 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.020215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  33.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  33.33 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  33.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  33.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  33.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  34.31 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  33.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  33.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  33.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  36.63 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  38 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  35.64 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0082  BolA family protein  30.93 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  39.36 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  32.32 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  40.43 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  33.01 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  30.39 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  32 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  32.35 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39406  predicted protein  32.69 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  31.37 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  30.39 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  33.67 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  35.96 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3078  BolA family protein  38.3 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  29.7 
 
 		 106 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  32.67 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  34.69 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  35.24 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  30.39 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  37.11 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  33.33 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  31.68 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  31.68 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  31.68 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  31.07 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  34.23 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  30.39 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  27.72 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  32.32 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  29.13 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  29.41 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  29.41 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  29.13 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  29.41 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  29.41 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  29.13 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  29.41 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  31.07 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  31.07 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  37.11 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1443  BolA-like protein  36.08 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  31.07 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  34.62 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1934  BolA-like protein  36.08 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3371  BolA-like protein  36.08 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2300  BolA/YrbA family protein  36.08 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2339  BolA/YrbA family protein  36.08 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1207  BolA-like protein  36.08 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  35.16 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  29.7 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>