209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0179 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  100 
 
 		 580 aa  1160    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  99.23 
 
 		 333 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  47.74 
 
 		 570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  48.56 
 
 		 559 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  42.17 
 
 		 594 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  38.7 
 
 		 550 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  41.41 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  39.27 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  35.66 
 
 		 545 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.27 
 
 		 544 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  36.78 
 
 		 325 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  36.78 
 
 		 325 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  30.51 
 
 		 558 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  36.23 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  33.43 
 
 		 325 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  36.95 
 
 		 325 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  34.43 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.43 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 525 aa  188  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  34.2 
 
 		 731 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.67 
 
 		 731 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  37 
 
 		 346 aa  183  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  35.01 
 
 		 344 aa  183  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  34.13 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.58 
 
 		 342 aa  182  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  37.42 
 
 		 326 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.94 
 
 		 341 aa  181  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.44 
 
 		 343 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.34 
 
 		 343 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.35 
 
 		 339 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  36.5 
 
 		 339 aa  177  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 727 aa  177  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  34.8 
 
 		 346 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  35.88 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.14 
 
 		 338 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.24 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.04 
 
 		 330 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  33.82 
 
 		 346 aa  173  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  31.21 
 
 		 333 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.6 
 
 		 344 aa  171  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  32.54 
 
 		 342 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  34.52 
 
 		 339 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.47 
 
 		 343 aa  170  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.83 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.23 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  33.23 
 
 		 331 aa  166  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  35.67 
 
 		 339 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.83 
 
 		 343 aa  165  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.53 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.66 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  33.63 
 
 		 344 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  31.86 
 
 		 343 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  33.69 
 
 		 343 aa  160  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.71 
 
 		 343 aa  158  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  37.37 
 
 		 343 aa  157  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  32.84 
 
 		 344 aa  157  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  34.03 
 
 		 336 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  31.95 
 
 		 344 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.54 
 
 		 344 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  31.31 
 
 		 336 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  31.46 
 
 		 334 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  33.57 
 
 		 343 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.8 
 
 		 347 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.95 
 
 		 347 aa  150  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.86 
 
 		 333 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.37 
 
 		 350 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.23 
 
 		 332 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  31.75 
 
 		 329 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.23 
 
 		 332 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  38.61 
 
 		 207 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  33.73 
 
 		 691 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  30.7 
 
 		 330 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.71 
 
 		 331 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  35.83 
 
 		 323 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  31.48 
 
 		 371 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.61 
 
 		 334 aa  127  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  27.08 
 
 		 331 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.46 
 
 		 330 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  32.36 
 
 		 336 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  23.51 
 
 		 330 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.6 
 
 		 330 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  29.8 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  27.36 
 
 		 331 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  22.88 
 
 		 331 aa  113  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  26.73 
 
 		 330 aa  113  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  25.48 
 
 		 330 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.78 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.75 
 
 		 337 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.64 
 
 		 319 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  24.13 
 
 		 333 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.78 
 
 		 331 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  29.48 
 
 		 337 aa  110  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.77 
 
 		 330 aa  110  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  21.38 
 
 		 326 aa  109  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  23.99 
 
 		 326 aa  109  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  24.76 
 
 		 330 aa  107  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  35.31 
 
 		 323 aa  107  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  27.16 
 
 		 330 aa  107  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  22.96 
 
 		 333 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.53 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>