18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0166 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0166  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  345  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1342  hypothetical protein  45.7 
 
 
238 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0167  hypothetical protein  60.22 
 
 
99 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02621  conserved hypothetical protein  36.65 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0854  hypothetical protein  39.53 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1370  hypothetical protein  34.26 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103597  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1367  hypothetical protein  35.33 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3082  hypothetical protein  36 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000103876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1368  hypothetical protein  42.31 
 
 
81 aa  55.1  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0277289  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1371  hypothetical protein  41.33 
 
 
78 aa  54.3  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794296  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1373  hypothetical protein  43.48 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00827993  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1369  hypothetical protein  37.08 
 
 
102 aa  51.6  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0323881  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1366  hypothetical protein  38.03 
 
 
104 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0265847  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2916  hypothetical protein  40.5 
 
 
122 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2880  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1586  hypothetical protein  29.73 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1372  hypothetical protein  43.84 
 
 
80 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00893716  normal  0.846814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0027  hypothetical protein  27.7 
 
 
509 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>