17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0100 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0100  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  231  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1597  hypothetical protein  57.02 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1519  hypothetical protein  51.79 
 
 		 114 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0825  hypothetical protein  53.21 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0797  hypothetical protein  53.21 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0808  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3756  hypothetical protein  49.11 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3805  hypothetical protein  49.11 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2803  hypothetical protein  50.45 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3429  hypothetical protein  42.34 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6727  hypothetical protein  43.24 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3678  hypothetical protein  46.24 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  hitchhiker  0.00469689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2645  hypothetical protein  43.12 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2306  hypothetical protein  43.12 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0023  hypothetical protein  32.35 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.807557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2398  anti-sigma-factor antagonist  34.43 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.460172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  20.75 
 
 		 392 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>