More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0098 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0098  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 403 aa  805    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2896  Cystathionine gamma-synthase  63.04 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.063757  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4085  cystathionine beta-lyase  61.73 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131173  normal  0.238155 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  55.72 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  55.9 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19090  cystathionine gamma-synthase  43.47 
 
 		 401 aa  305  9.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  42.94 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5066  Cystathionine gamma-lyase  41.6 
 
 		 401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  41.84 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  39.33 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1986  Cystathionine gamma-lyase  41.62 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258537  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.25 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.93 
 
 		 397 aa  273  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  41 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  41.9 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  42.49 
 
 		 385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 378 aa  269  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  42.97 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  41.6 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.75 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  37.18 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  42.93 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  36.41 
 
 		 392 aa  265  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  41.98 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.9 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.82 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  41.35 
 
 		 426 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  43.29 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  40.3 
 
 		 393 aa  262  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  40.61 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  44.29 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  42.18 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  42.57 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  42.31 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  41.73 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  39.39 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.81 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  41.27 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  39.59 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.66 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  39.14 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.66 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.46 
 
 		 392 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.66 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.57 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 		 380 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  40.36 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  41.13 
 
 		 379 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  42.86 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.69 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.95 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.4 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  37.6 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.4 
 
 		 423 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.4 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.4 
 
 		 423 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  41.43 
 
 		 377 aa  255  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  40.97 
 
 		 387 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39.85 
 
 		 390 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.96 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.56 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  40.4 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  42.46 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.1 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.6 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  39.59 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.1 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  42.46 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  42.46 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  38.07 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  40.25 
 
 		 394 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  41.79 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.57 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.98 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  38.01 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.96 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.2 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  37.95 
 
 		 377 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  37.95 
 
 		 377 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.15 
 
 		 405 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  40.66 
 
 		 376 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  36.83 
 
 		 378 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.23 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  41.73 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.98 
 
 		 406 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  42.97 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  41.48 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  41.71 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  43.15 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  42.6 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.78 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.9 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  37.69 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  37.44 
 
 		 377 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  37.69 
 
 		 377 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  37.69 
 
 		 377 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  37.18 
 
 		 377 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>