31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0090 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  100 
 
 		 80 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  82.05 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  82.89 
 
 		 80 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  75 
 
 		 79 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  61.45 
 
 		 83 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  60.24 
 
 		 83 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  57.38 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  48.15 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  41.46 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  46.97 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  41.79 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  42.19 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  36.9 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  46 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  44.16 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  45 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  45.9 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  41.79 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  41.79 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  46 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 88 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  40.43 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  36.84 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  32.1 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  34.21 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>