More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0064 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  100 
 
 		 687 aa  1362    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  51.91 
 
 		 399 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  49.36 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  53.17 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  50.52 
 
 		 397 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  50.52 
 
 		 397 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  53.93 
 
 		 382 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.93 
 
 		 408 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  52.65 
 
 		 380 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  43.41 
 
 		 397 aa  350  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  49.11 
 
 		 395 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  48.86 
 
 		 395 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  49.23 
 
 		 395 aa  327  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  49.23 
 
 		 395 aa  327  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  49.23 
 
 		 395 aa  326  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  48.85 
 
 		 395 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  48.97 
 
 		 395 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.23 
 
 		 396 aa  323  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.26 
 
 		 394 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.26 
 
 		 394 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.26 
 
 		 394 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  50 
 
 		 389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.48 
 
 		 396 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.48 
 
 		 396 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  47.84 
 
 		 398 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  47.87 
 
 		 390 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  47.55 
 
 		 390 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  46.75 
 
 		 392 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2242  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.1 
 
 		 397 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  46.68 
 
 		 454 aa  304  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  48.69 
 
 		 398 aa  300  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  44.25 
 
 		 535 aa  298  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  48.16 
 
 		 382 aa  293  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  43.75 
 
 		 401 aa  273  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 		 375 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.99 
 
 		 347 aa  251  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  40.89 
 
 		 368 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  39.37 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  48.29 
 
 		 283 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  46.76 
 
 		 279 aa  216  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  46.67 
 
 		 283 aa  216  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  50.56 
 
 		 284 aa  210  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  45.52 
 
 		 283 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  46.47 
 
 		 279 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  43.87 
 
 		 279 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  44.84 
 
 		 279 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  47.28 
 
 		 283 aa  203  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  44.94 
 
 		 279 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  46.94 
 
 		 283 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  46.21 
 
 		 278 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  44.98 
 
 		 278 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  45.69 
 
 		 282 aa  201  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  46.26 
 
 		 285 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  44.37 
 
 		 294 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  48.77 
 
 		 290 aa  196  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5178  squalene/phytoene synthase  43.84 
 
 		 286 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5681  squalene/phytoene synthase  43.84 
 
 		 344 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  hitchhiker  0.0020025 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4554  squalene synthase HpnD  43.84 
 
 		 282 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124742  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4953  squalene/phytoene synthase  43.84 
 
 		 282 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  normal  0.0913001 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  43.48 
 
 		 282 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5506  squalene synthase HpnD  43.48 
 
 		 282 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0017  squalene/phytoene synthase  43.12 
 
 		 282 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  42.39 
 
 		 397 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  45.36 
 
 		 298 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  43.12 
 
 		 306 aa  184  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  41.67 
 
 		 282 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  41.67 
 
 		 282 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  41.67 
 
 		 282 aa  180  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  41.67 
 
 		 282 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  41.67 
 
 		 282 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  42.91 
 
 		 282 aa  180  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  41.67 
 
 		 275 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  42.42 
 
 		 290 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4953  squalene/phytoene synthase  45.15 
 
 		 301 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251638  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  38.87 
 
 		 285 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  38.06 
 
 		 280 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  36.23 
 
 		 288 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  34.91 
 
 		 278 aa  155  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  39.2 
 
 		 278 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  37.02 
 
 		 277 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  36.5 
 
 		 277 aa  150  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  34.93 
 
 		 279 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  35 
 
 		 279 aa  147  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  34.93 
 
 		 280 aa  147  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  35.66 
 
 		 293 aa  142  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 393 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  32.63 
 
 		 293 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  33.82 
 
 		 279 aa  138  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  34.32 
 
 		 280 aa  137  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 383 aa  137  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  36.26 
 
 		 289 aa  134  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  31.75 
 
 		 268 aa  132  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  36.03 
 
 		 281 aa  132  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  33.46 
 
 		 279 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  35.34 
 
 		 287 aa  127  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 		 381 aa  127  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 385 aa  127  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 		 384 aa  127  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  41.78 
 
 		 304 aa  125  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 		 403 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>