207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0057 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  100 
 
 		 889 aa  1713    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.27 
 
 		 887 aa  492  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  39.73 
 
 		 882 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  36.01 
 
 		 890 aa  482  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  35.55 
 
 		 901 aa  474  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.72 
 
 		 882 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.62 
 
 		 882 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.66 
 
 		 882 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.55 
 
 		 895 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  36.14 
 
 		 884 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.99 
 
 		 882 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  37.41 
 
 		 879 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  36.42 
 
 		 862 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.47 
 
 		 900 aa  445  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.94 
 
 		 868 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.13 
 
 		 864 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  36.35 
 
 		 862 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  35.98 
 
 		 901 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  37.13 
 
 		 908 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.97 
 
 		 871 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  35.28 
 
 		 872 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  35.39 
 
 		 887 aa  412  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  35.65 
 
 		 871 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.66 
 
 		 877 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  36.47 
 
 		 868 aa  403  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.99 
 
 		 877 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  37.64 
 
 		 877 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  35.79 
 
 		 969 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  35.65 
 
 		 877 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  35.65 
 
 		 877 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  35.84 
 
 		 1079 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.74 
 
 		 870 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1083 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.84 
 
 		 877 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.31 
 
 		 669 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  35.99 
 
 		 868 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  35.73 
 
 		 877 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  35.75 
 
 		 877 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  35.63 
 
 		 877 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  35.94 
 
 		 877 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  35.75 
 
 		 877 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  35.43 
 
 		 877 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  36.36 
 
 		 877 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  33.77 
 
 		 767 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  37.3 
 
 		 858 aa  365  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  29.34 
 
 		 892 aa  331  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  29.01 
 
 		 1128 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  36.1 
 
 		 864 aa  318  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.04 
 
 		 886 aa  293  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  30.79 
 
 		 899 aa  293  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  29.1 
 
 		 920 aa  289  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.52 
 
 		 883 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.49 
 
 		 883 aa  278  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  27.2 
 
 		 910 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  28 
 
 		 972 aa  230  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  27.24 
 
 		 893 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.2 
 
 		 1045 aa  201  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  27.64 
 
 		 906 aa  156  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  27.05 
 
 		 849 aa  108  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  26.61 
 
 		 847 aa  104  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  23.68 
 
 		 839 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  28.15 
 
 		 845 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  24.47 
 
 		 840 aa  72  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  23.76 
 
 		 1204 aa  70.5  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  39.08 
 
 		 782 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  24.71 
 
 		 846 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  24.71 
 
 		 840 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  24.22 
 
 		 791 aa  67.4  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  27.27 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  30.54 
 
 		 787 aa  64.7  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  30.09 
 
 		 820 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  28.66 
 
 		 797 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  30.06 
 
 		 792 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  32.18 
 
 		 862 aa  62  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  27.33 
 
 		 843 aa  62  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  26.39 
 
 		 1287 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  30.48 
 
 		 810 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  25.56 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  29.94 
 
 		 790 aa  61.6  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  28.65 
 
 		 855 aa  61.2  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26.05 
 
 		 764 aa  60.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.28 
 
 		 798 aa  60.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  29.59 
 
 		 816 aa  60.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  24.26 
 
 		 1011 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  25 
 
 		 831 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.81 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  25.09 
 
 		 800 aa  59.7  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  35.54 
 
 		 895 aa  59.3  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.05 
 
 		 837 aa  59.3  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  26.12 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  24.14 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  26.11 
 
 		 778 aa  58.9  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  27.27 
 
 		 1225 aa  57.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  22.25 
 
 		 777 aa  55.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  22.67 
 
 		 881 aa  56.2  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  24.34 
 
 		 1359 aa  55.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  29.94 
 
 		 797 aa  55.8  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  35.29 
 
 		 778 aa  55.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.4 
 
 		 773 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.17 
 
 		 1291 aa  54.7  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>