More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0047 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  100 
 
 		 535 aa  1057    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  66.16 
 
 		 527 aa  680    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  60.76 
 
 		 530 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  61.52 
 
 		 531 aa  621  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  63.43 
 
 		 527 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  59.39 
 
 		 545 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  57.71 
 
 		 534 aa  538  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  55.75 
 
 		 524 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  55.89 
 
 		 531 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  55.08 
 
 		 532 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  51.24 
 
 		 533 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  53.9 
 
 		 525 aa  495  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  52.57 
 
 		 534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  47.15 
 
 		 526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 524 aa  360  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  34.79 
 
 		 534 aa  341  2e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  40.71 
 
 		 541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 		 539 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  39.23 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 		 549 aa  307  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 536 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 544 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 		 536 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  39.51 
 
 		 537 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  39.51 
 
 		 537 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  39.51 
 
 		 537 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  39.81 
 
 		 516 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  37.69 
 
 		 535 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 548 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  39.7 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  39.43 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  37.57 
 
 		 557 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 558 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 548 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 548 aa  286  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 548 aa  286  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 548 aa  286  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 548 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 548 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 548 aa  286  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  38.35 
 
 		 546 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  38 
 
 		 555 aa  279  7e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  37.36 
 
 		 551 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  37.36 
 
 		 551 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  36.93 
 
 		 546 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  37.31 
 
 		 553 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.98 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.05 
 
 		 538 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  37.2 
 
 		 550 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  34.55 
 
 		 541 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 		 532 aa  263  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  36.28 
 
 		 511 aa  255  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29.94 
 
 		 529 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  37.9 
 
 		 565 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  30.29 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  34.2 
 
 		 531 aa  249  9e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.67 
 
 		 531 aa  249  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  28.84 
 
 		 529 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  31.05 
 
 		 529 aa  243  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.79 
 
 		 529 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  36.47 
 
 		 520 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  28.92 
 
 		 530 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  34.54 
 
 		 525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 535 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  32.14 
 
 		 530 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  34.1 
 
 		 525 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  34.1 
 
 		 535 aa  227  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  29.37 
 
 		 523 aa  223  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0084  ABC transporter related  61.81 
 
 		 209 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  33.58 
 
 		 615 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  33.58 
 
 		 615 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  33.82 
 
 		 627 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.87 
 
 		 555 aa  217  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  30.83 
 
 		 643 aa  216  7e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  31.89 
 
 		 637 aa  216  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  33.15 
 
 		 642 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 641 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.1 
 
 		 634 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  29.91 
 
 		 645 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.81 
 
 		 550 aa  213  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  33.67 
 
 		 627 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  32.97 
 
 		 627 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.11 
 
 		 634 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  32.4 
 
 		 627 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  33.7 
 
 		 542 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  35.8 
 
 		 623 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  32.28 
 
 		 644 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  30.38 
 
 		 656 aa  210  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  29.89 
 
 		 519 aa  210  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  30.96 
 
 		 580 aa  209  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.4 
 
 		 639 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  35.31 
 
 		 623 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  33.08 
 
 		 620 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  31.53 
 
 		 648 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 		 627 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 		 545 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  35.59 
 
 		 615 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  29.08 
 
 		 646 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>