More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0014 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  100 
 
 
366 aa  722    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  56.15 
 
 
329 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  59.43 
 
 
323 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  53.64 
 
 
337 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  52.03 
 
 
336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  55.31 
 
 
322 aa  336  3.9999999999999995e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  59.94 
 
 
315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  57.91 
 
 
331 aa  335  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  52.33 
 
 
336 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  55.31 
 
 
338 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  54.88 
 
 
325 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  53.42 
 
 
331 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  54.17 
 
 
338 aa  332  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  51.82 
 
 
337 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  58.86 
 
 
353 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  54.04 
 
 
331 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  53.94 
 
 
325 aa  328  7e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  57.37 
 
 
320 aa  328  8e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  58.44 
 
 
340 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  54.02 
 
 
338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  50.45 
 
 
334 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  50.93 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  54.52 
 
 
341 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  55 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  54.55 
 
 
321 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  55.03 
 
 
323 aa  320  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  55.1 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  53.42 
 
 
320 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.76 
 
 
359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.76 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  52.63 
 
 
321 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  53.77 
 
 
333 aa  308  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  52.89 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  52.81 
 
 
321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  53.25 
 
 
331 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  49.05 
 
 
324 aa  305  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.92 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  48.9 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  52.01 
 
 
321 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  51.25 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  50.95 
 
 
324 aa  302  7.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  53.58 
 
 
326 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  52.58 
 
 
341 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 
322 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  50.16 
 
 
326 aa  299  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  50.46 
 
 
324 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 
322 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  53.58 
 
 
340 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  52.12 
 
 
333 aa  297  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  50.46 
 
 
324 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  51.82 
 
 
325 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  50.15 
 
 
324 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  52.37 
 
 
326 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  50.8 
 
 
339 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  52.81 
 
 
322 aa  295  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  50.91 
 
 
345 aa  295  9e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  50.91 
 
 
345 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  51.72 
 
 
324 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  52.05 
 
 
324 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  50.15 
 
 
324 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  52.19 
 
 
333 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  52.08 
 
 
329 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  52.65 
 
 
340 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  47.84 
 
 
330 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  50.94 
 
 
344 aa  292  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  52.52 
 
 
333 aa  292  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.47 
 
 
328 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  47.13 
 
 
320 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  47.13 
 
 
320 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  48.77 
 
 
324 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  50.32 
 
 
326 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.16 
 
 
328 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.16 
 
 
328 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.16 
 
 
328 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.16 
 
 
328 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  49.38 
 
 
324 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.77 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  49.21 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  288  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  52.29 
 
 
341 aa  288  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.16 
 
 
328 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 
328 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  49.54 
 
 
323 aa  287  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  50.46 
 
 
354 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  49.84 
 
 
328 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  51.08 
 
 
335 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  48.9 
 
 
323 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  48.9 
 
 
325 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  48.9 
 
 
323 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  47.19 
 
 
323 aa  286  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  45.89 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.9 
 
 
328 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  46.06 
 
 
321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  47.35 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>