14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0013 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  31.63 
 
 		 246 aa  99.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  29.05 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  29.25 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  26.03 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0335  protein of unknown function DUF1239  26.79 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143778  normal  0.315506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4955  hypothetical protein  27.01 
 
 		 212 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  23.23 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  27.04 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0227  hypothetical protein  23.04 
 
 		 198 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  21.69 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  23.17 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  21.36 
 
 		 237 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>