More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0011 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  100 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  73.14 
 
 		 263 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  73.95 
 
 		 264 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  73.53 
 
 		 267 aa  350  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  63.64 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  68.07 
 
 		 253 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  68.07 
 
 		 253 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  68.07 
 
 		 253 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  69.2 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  66.39 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  66.4 
 
 		 317 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  67.51 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  67.51 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  68.33 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  67.51 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  65.97 
 
 		 249 aa  322  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  66.39 
 
 		 244 aa  321  7e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  67.93 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  67.5 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  65.55 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  65.97 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  65.02 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.14 
 
 		 336 aa  318  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  67.09 
 
 		 321 aa  318  6e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  67.51 
 
 		 317 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  67.09 
 
 		 270 aa  318  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  67.09 
 
 		 316 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  65.55 
 
 		 267 aa  318  9e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  67.93 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  66.67 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  63.6 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  64.78 
 
 		 261 aa  315  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  63.74 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  61.6 
 
 		 256 aa  311  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  62.65 
 
 		 290 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  66.52 
 
 		 289 aa  310  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  65.82 
 
 		 283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  65.4 
 
 		 258 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  64.41 
 
 		 253 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  64.98 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.87 
 
 		 268 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  59.66 
 
 		 241 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  59.66 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.98 
 
 		 241 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  59.49 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  59.24 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  58.82 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  60.08 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  57.2 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  55.84 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  60.5 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  57.81 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  60.92 
 
 		 239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  57.98 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  57.56 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  57.56 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  57.56 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  57.98 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  59.66 
 
 		 262 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  59.66 
 
 		 262 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.4 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  57.98 
 
 		 241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  56.16 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 249 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 249 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  58.37 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 		 261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  59.91 
 
 		 254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 246 aa  282  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  58.68 
 
 		 255 aa  282  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  53.96 
 
 		 268 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  55.51 
 
 		 261 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 245 aa  282  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  57.56 
 
 		 241 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.56 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  54.62 
 
 		 241 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  59.24 
 
 		 241 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  58.68 
 
 		 255 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  56.37 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  57.14 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  55.7 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  56.3 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  59.84 
 
 		 263 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  55.21 
 
 		 260 aa  278  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  59.11 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  58.16 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  59.84 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>