More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4852 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3775  putative oxidoreductase  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4852  putative oxidoreductase  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1976  putative oxidoreductase  81.82 
 
 
291 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6338  putative oxidoreductase  85.71 
 
 
291 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6038  putative oxidoreductase  85.31 
 
 
291 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.796364 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6342  putative oxidoreductase  78.32 
 
 
291 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3561  putative oxidoreductase  77.27 
 
 
292 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4576  putative oxidoreductase  77.7 
 
 
291 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25594  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3959  putative oxidoreductase  76.57 
 
 
290 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102223 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6037  aldo/keto reductase  76.57 
 
 
293 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0218  aldo/keto reductase  76.06 
 
 
293 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3802  aldo/keto reductase  75.52 
 
 
293 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1859  putative oxidoreductase  72.16 
 
 
297 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1587  putative oxidoreductase  73.14 
 
 
286 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2239  aldo/keto reductase  72.44 
 
 
286 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2252  putative oxidoreductase  72.44 
 
 
286 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103537  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2008  putative oxidoreductase  72.44 
 
 
286 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.865157  normal  0.493035 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1489  putative oxidoreductase  72.44 
 
 
286 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5911  putative oxidoreductase  72.82 
 
 
292 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360934  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2112  putative oxidoreductase  71.78 
 
 
288 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6534  putative oxidoreductase  70.55 
 
 
315 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.35079 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1766  putative oxidoreductase  72.44 
 
 
286 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1935  aldo/keto reductase  73.17 
 
 
289 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0134693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0010  putative oxidoreductase  68.46 
 
 
300 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2776  putative oxidoreductase  70.63 
 
 
292 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4700  aldo/keto reductase  74.38 
 
 
297 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0809909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2685  aldo/keto reductase  68.53 
 
 
302 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.346212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3184  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  66.67 
 
 
287 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3050  putative oxidoreductase  67.26 
 
 
287 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378412  normal  0.0203224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2646  putative oxidoreductase  66.2 
 
 
293 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5769  putative oxidoreductase  65.23 
 
 
311 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0299  putative oxidoreductase  62.32 
 
 
292 aa  358  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876534  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19120  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  62.19 
 
 
310 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.418593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1340  aldo/keto reductase  61.35 
 
 
293 aa  345  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1317  aldo/keto reductase  60.43 
 
 
290 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329831  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1273  putative oxidoreductase  58.04 
 
 
292 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4436  aldo/keto reductase  58.67 
 
 
274 aa  309  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1135  aldo/keto reductase  58.89 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6751  aldo/keto reductase  57.35 
 
 
275 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4941  aldo/keto reductase  51.74 
 
 
322 aa  292  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01361  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  73.53 
 
 
177 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01373  hypothetical protein  73.53 
 
 
173 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5322  aldo/keto reductase  49.47 
 
 
285 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5411  aldo/keto reductase  49.47 
 
 
285 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5701  aldo/keto reductase  49.47 
 
 
285 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4872  aldo/keto reductase  47.75 
 
 
292 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4961  aldo/keto reductase  47.75 
 
 
292 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5463  aldo/keto reductase  46.5 
 
 
292 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1329  aldo/keto reductase  49.63 
 
 
291 aa  242  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398839  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  49.26 
 
 
293 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  48.16 
 
 
293 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  45.49 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  47 
 
 
289 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2727  aldo/keto reductase  46.83 
 
 
296 aa  232  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  45.16 
 
 
293 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3447  aldo/keto reductase  48.01 
 
 
280 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5796  aldo/keto reductase  45.86 
 
 
294 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869077  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
279 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6541  aldo/keto reductase  43.11 
 
 
288 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0425  aldo/keto reductase  45.79 
 
 
309 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
286 aa  218  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2555  aldo/keto reductase  48.33 
 
 
289 aa  218  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7191  aldo/keto reductase  41.55 
 
 
281 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633848  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
281 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2191  aldo/keto reductase  40.91 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.41887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  41.84 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  44.01 
 
 
290 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
300 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2941  aldo/keto reductase  41.13 
 
 
284 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3405  aldo/keto reductase  42.96 
 
 
304 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0104  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
293 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  41.13 
 
 
288 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1388  aldo/keto reductase  41.13 
 
 
286 aa  205  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  42.76 
 
 
285 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0942  aldo/keto reductase  45.49 
 
 
324 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  42.2 
 
 
280 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5154  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0114  aldo/keto reductase  38.14 
 
 
293 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4689  aldo/keto reductase  41.38 
 
 
292 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  40.78 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5232  aldo/keto reductase  40.07 
 
 
292 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109633  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0510  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  39.37 
 
 
292 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.372806  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2084  aldo/keto reductase  41.2 
 
 
295 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2833  aldo/keto reductase  37.59 
 
 
291 aa  191  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0361368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5279  putative oxidoreductase  40.96 
 
 
302 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  40.4 
 
 
291 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4269  aldo/keto reductase  41.38 
 
 
287 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.521186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  41.91 
 
 
290 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1525  aldo/keto reductase  38.54 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  38.03 
 
 
300 aa  188  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  38.73 
 
 
287 aa  187  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5118  aldo/keto reductase  41.92 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.456075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4547  aldo/keto reductase  43.54 
 
 
278 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.877781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5228  aldo/keto reductase  44.01 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3205  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
319 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0370321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0889  aldo/keto reductase  40.67 
 
 
268 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0531022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3551  aldo/keto reductase  38.38 
 
 
300 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4399  aldo/keto reductase  42.35 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278504  hitchhiker  0.00297654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
331 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.15 
 
 
334 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>