More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4778 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  80.33 
 
 		 246 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  76.21 
 
 		 250 aa  380  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  76.54 
 
 		 244 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  75.1 
 
 		 242 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  73.42 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  73 
 
 		 239 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  65.8 
 
 		 239 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  66.38 
 
 		 241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  63.03 
 
 		 244 aa  315  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  42.16 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  30.32 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  33.11 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.82 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 178 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.22 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 1106 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  36.57 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  36.17 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.88 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.32 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1986  methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  39.34 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  43.3 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.52 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.15 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.56 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  30 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.25 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  31.58 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  30.37 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  30.37 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.31 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.89 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  29.41 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  35.35 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.94 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.32 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.54 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 328 aa  62  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 173 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.64 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  32.73 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  30.72 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  31.05 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>