286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4759 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
262 aa  505  1e-142  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
262 aa  505  1e-142  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  87.79 
 
 
262 aa  459  1e-128  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  40.4 
 
 
260 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  40.55 
 
 
260 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  40.55 
 
 
260 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  40.55 
 
 
260 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  43.14 
 
 
260 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  41.73 
 
 
260 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  42.35 
 
 
260 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  42.35 
 
 
260 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  42.35 
 
 
260 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  42.35 
 
 
260 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  42.35 
 
 
260 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  42.35 
 
 
260 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  42.35 
 
 
260 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  38.19 
 
 
260 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  42.4 
 
 
262 aa  185  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  40.55 
 
 
260 aa  185  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  38.61 
 
 
261 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  40 
 
 
261 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  41.34 
 
 
260 aa  183  2e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  41.34 
 
 
260 aa  183  2e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  37.4 
 
 
260 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  38.68 
 
 
264 aa  178  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  40.76 
 
 
260 aa  173  2e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  36.65 
 
 
261 aa  172  7e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.88 
 
 
261 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  37.4 
 
 
260 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  39.51 
 
 
260 aa  162  4e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  39.51 
 
 
260 aa  162  4e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  39.92 
 
 
265 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  39.68 
 
 
264 aa  161  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  37.86 
 
 
264 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  37.45 
 
 
264 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  37.45 
 
 
264 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  37.45 
 
 
264 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  37.04 
 
 
264 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.10874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  37.35 
 
 
256 aa  151  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  37.86 
 
 
261 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2959  flagellar biosynthesis protein FliR  38.68 
 
 
260 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  37.86 
 
 
261 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.55568e-06  normal  0.0138418 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  37.86 
 
 
261 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.12821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  37.86 
 
 
261 aa  148  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.14634e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  37.86 
 
 
261 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.59397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  36.8 
 
 
256 aa  148  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  37.39 
 
 
261 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  37.45 
 
 
261 aa  148  1e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.09979e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  36.44 
 
 
256 aa  147  1e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  35.86 
 
 
260 aa  147  2e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  37.45 
 
 
261 aa  145  4e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.09328e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  39.63 
 
 
247 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  40 
 
 
266 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  35.24 
 
 
257 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  39.16 
 
 
256 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  34.3 
 
 
261 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  33.07 
 
 
258 aa  141  1e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  35.87 
 
 
265 aa  139  5e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  37.6 
 
 
264 aa  138  8e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  35.87 
 
 
265 aa  138  8e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  36 
 
 
261 aa  138  9e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  36.56 
 
 
258 aa  138  9e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  37.2 
 
 
253 aa  138  9e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  35.98 
 
 
247 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  35.87 
 
 
265 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  32.91 
 
 
247 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  34.43 
 
 
258 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  31.33 
 
 
261 aa  136  3e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  34.98 
 
 
265 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  34.55 
 
 
265 aa  135  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  35.14 
 
 
260 aa  133  2e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  34.2 
 
 
265 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  34.2 
 
 
265 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  34.2 
 
 
265 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  36.48 
 
 
240 aa  132  4e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  33.77 
 
 
265 aa  132  8e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  36.24 
 
 
258 aa  132  8e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  34.39 
 
 
253 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  40.77 
 
 
259 aa  131  1e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  33.2 
 
 
258 aa  130  2e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  34.08 
 
 
265 aa  130  2e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  36.12 
 
 
258 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  32.47 
 
 
265 aa  129  5e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  34.8 
 
 
257 aa  127  1e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 
263 aa  127  2e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  35.37 
 
 
258 aa  127  2e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 
259 aa  127  2e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  38.26 
 
 
258 aa  127  2e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  31.84 
 
 
267 aa  127  2e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  38.77 
 
 
258 aa  126  4e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  31.76 
 
 
266 aa  125  8e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  33.19 
 
 
260 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  37.24 
 
 
236 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  32.33 
 
 
260 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  32.31 
 
 
260 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  34.11 
 
 
261 aa  121  1e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  31.2 
 
 
259 aa  120  2e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  33.79 
 
 
260 aa  119  4e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  32.33 
 
 
262 aa  119  4e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.66 
 
 
267 aa  119  5e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>