More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4745 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  288  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  288  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_003296  RS00814  putative transcription regulator protein  86.39 
 
 		 147 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.52 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  51.43 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  49.3 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  51.06 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  52.48 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  50.35 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  57.25 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.08 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  51.77 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  51.77 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 156 aa  139  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 165 aa  139  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  54.74 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  50 
 
 		 152 aa  136  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 155 aa  136  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 165 aa  135  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 185 aa  135  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3592  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.568766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.36 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.36 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  42.36 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  49.61 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  41.78 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  42.66 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  52.8 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  57.02 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  52.48 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  49.63 
 
 		 156 aa  133  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 168 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 165 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  51.69 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  53.03 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  49.63 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  47.14 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  47.52 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  52.14 
 
 		 143 aa  130  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  48.18 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  50 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 		 166 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 157 aa  127  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  47.95 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  48.57 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  48.51 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  54.39 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  52.73 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  55.36 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  56.48 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  48.97 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>