More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4744 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  100 
 
 		 140 aa  279  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  100 
 
 		 140 aa  279  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  66.67 
 
 		 190 aa  173  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001046  organic hydroperoxide resistance protein  65.44 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04764  redox protein, regulator of disulfide bond formation  63.97 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1244  OsmC family protein  59.71 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000339163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  60.87 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  58.82 
 
 		 147 aa  160  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1386  OsmC family protein  63.24 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  60.14 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0231  putative organic hydroperoxide resistance protein  60.29 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0814  OsmC family protein  59.56 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000492477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3597  OsmC family protein  60.29 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000950914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3057  OsmC family protein  58.82 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2314  OsmC family protein  60 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.158438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1516  OsmC family protein  59.56 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000023625  hitchhiker  0.00144478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3591  OsmC-like protein  61.97 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.572762 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  58.99 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  58.7 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3209  OsmC family protein  58.82 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  58.82 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3312  OsmC family protein  58.82 
 
 		 141 aa  156  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0976  organic hydroperoxide resistance protein  57.35 
 
 		 141 aa  156  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3427  OsmC family protein  58.09 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1954  hypothetical protein  54.29 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1949  hypothetical protein  53.57 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  57.97 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3622  OsmC family protein  57.35 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.867259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3330  organic hydroperoxide resistance protein  65.85 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.316626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3499  OsmC family protein  57.35 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  57.25 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0865  OsmC family protein  56.62 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  56.2 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  52.21 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  55.07 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  58.52 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  57.25 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  55.4 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  57.78 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  55.4 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  55.07 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  54.68 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  58.09 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  55.15 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  58.09 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  54.35 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  54.35 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  55.15 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  55.4 
 
 		 139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  57.35 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  57.35 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  54.01 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  57.66 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1190  organic hydroperoxide resistance protein  55.07 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.481185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  53.96 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  55.15 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  53.96 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  53.96 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  56.62 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  55.07 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  57.35 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  55.07 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  56.62 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  51.82 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  51.82 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  51.82 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  52.21 
 
 		 141 aa  137  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  55.64 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  54.41 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0109  organic hydroperoxide resistance protein  55.4 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  51.82 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  53.33 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  51.45 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  53.62 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  53.62 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0446  OsmC-like protein protein  55.15 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.379428  normal  0.212625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  54.89 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  54.01 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  55.15 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  56.39 
 
 		 141 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  57.97 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  53.62 
 
 		 141 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  48.92 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  52.17 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  50.74 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  54.14 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  52.9 
 
 		 141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>