259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4731 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  86.64 
 
 		 611 aa  971    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 611 aa  1233    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 611 aa  1233    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  50.78 
 
 		 567 aa  522  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  50.96 
 
 		 587 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  51.62 
 
 		 587 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  50.09 
 
 		 677 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  51.62 
 
 		 587 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  51.62 
 
 		 587 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  51.57 
 
 		 587 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  50.81 
 
 		 587 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  51.56 
 
 		 563 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  50.63 
 
 		 587 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  51.19 
 
 		 568 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  49.31 
 
 		 600 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  49.4 
 
 		 598 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  49.57 
 
 		 603 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  49.4 
 
 		 598 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  49.4 
 
 		 598 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  49.23 
 
 		 598 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  49.23 
 
 		 598 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  49.23 
 
 		 598 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  49.23 
 
 		 598 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  47.55 
 
 		 584 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  47.39 
 
 		 593 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  47.66 
 
 		 548 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  55.49 
 
 		 560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  45.93 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  45.93 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  45.93 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  45.93 
 
 		 552 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  46.34 
 
 		 563 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  45.57 
 
 		 552 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  46.51 
 
 		 566 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  46.1 
 
 		 565 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  46.15 
 
 		 586 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  45.75 
 
 		 552 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  45.91 
 
 		 579 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  45.91 
 
 		 576 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  45.91 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  45.91 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  46.09 
 
 		 579 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  44.33 
 
 		 566 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  45.83 
 
 		 570 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  45.83 
 
 		 570 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  46.02 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  45.83 
 
 		 570 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  46.48 
 
 		 576 aa  428  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  44.44 
 
 		 569 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  44.86 
 
 		 567 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  44.25 
 
 		 569 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  44.14 
 
 		 564 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  44.14 
 
 		 564 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  43.55 
 
 		 594 aa  412  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  43.77 
 
 		 562 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  44 
 
 		 574 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  48.5 
 
 		 571 aa  402  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  42.39 
 
 		 588 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  43.51 
 
 		 576 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  38.72 
 
 		 552 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  38.96 
 
 		 567 aa  361  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  37.54 
 
 		 558 aa  340  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  38.63 
 
 		 590 aa  334  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  37.2 
 
 		 597 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  37.04 
 
 		 598 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  36.47 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  37.97 
 
 		 580 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  37.18 
 
 		 592 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  37.35 
 
 		 592 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  37.18 
 
 		 592 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  36.96 
 
 		 556 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  36.71 
 
 		 595 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  36.1 
 
 		 592 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  36.44 
 
 		 594 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  35.92 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  34.75 
 
 		 544 aa  304  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  36 
 
 		 552 aa  301  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  34.75 
 
 		 544 aa  301  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  37.18 
 
 		 568 aa  284  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  35.28 
 
 		 594 aa  283  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  33.39 
 
 		 595 aa  279  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  36.55 
 
 		 527 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  32.43 
 
 		 525 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  34.77 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  33.53 
 
 		 530 aa  266  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  35.88 
 
 		 522 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  35.93 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  35.71 
 
 		 527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  34.85 
 
 		 528 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  34.46 
 
 		 551 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1287  flagellar M-ring protein FliF  40.7 
 
 		 578 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.930135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  35.22 
 
 		 574 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  35.22 
 
 		 574 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  30.62 
 
 		 539 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  33.4 
 
 		 519 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  32.43 
 
 		 569 aa  250  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  36.53 
 
 		 537 aa  250  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  32.25 
 
 		 583 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.67 
 
 		 541 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  36.32 
 
 		 536 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>