93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4715 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3638  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 324 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4715  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  decreased coverage  0.00436912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1061  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  27.63 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  28.02 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1429  beta-lactamase domain-containing protein  23.13 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 		 862 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  26.98 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  28.3 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  32.16 
 
 		 242 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 		 206 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  27.48 
 
 		 229 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  30.46 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  32.52 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2362  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  31.25 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2207  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  30.2 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2969  metallo-beta-lactamase family protein  25.67 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  26.12 
 
 		 214 aa  46.2  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 378 aa  45.8  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0612  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1096  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  25.67 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 214 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3406  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.317826  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  25.86 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.45 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  27.03 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2235  metallo-beta-lactamase family protein  25.67 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2399  metallo-beta-lactamase family protein  25.67 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.295399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  26.16 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  27.92 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  23.7 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  34.04 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.05 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  24.85 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 329 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  27.75 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 		 206 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.37 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3102  hypothetical protein  29.94 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  24.85 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  25.1 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  35.87 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  22.73 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  28.95 
 
 		 209 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  26.49 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 226 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.62 
 
 		 216 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>