More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4675 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  86.94 
 
 		 222 aa  364  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  78.7 
 
 		 217 aa  326  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  77.31 
 
 		 217 aa  318  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  73.13 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  73.13 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  73.13 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  73.13 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  73.13 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  73.13 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  73.13 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  73.57 
 
 		 233 aa  314  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  63.43 
 
 		 221 aa  266  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.45 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  52.97 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 219 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.2 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 256 aa  181  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  45.45 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  45.54 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  45.54 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  46.76 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 237 aa  171  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  47.37 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.47 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  47.42 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.78 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3764  two component LuxR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 1648 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  44.29 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  44.29 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  47.83 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.32 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  44.29 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  44.29 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  44.29 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  42.53 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  44.02 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  44.02 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 209 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  42.18 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.4 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  43.87 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 250 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.38 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 303 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  41.51 
 
 		 242 aa  157  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.2 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 218 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  46.15 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  43.13 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  43.13 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>