273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4667 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0973  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  93.49 
 
 		 461 aa  819    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1730  nitrate/nitrite transporter NarK  79.39 
 
 		 461 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3590  nitrite transporter  100 
 
 		 461 aa  920    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494502  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5001  nitrate transporter  81.56 
 
 		 461 aa  758    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0909431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2679  nitrite extrusion protein  79.61 
 
 		 490 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2755  nitrate/nitrite transporter NarK  79.61 
 
 		 461 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2623  nitrite extrusion protein  79.61 
 
 		 490 aa  722    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0334  nitrate transporter  68.04 
 
 		 475 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000163846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1855  nitrate/nitrite transporter NarK  80.04 
 
 		 461 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1512  nitrite extrusion protein  79.39 
 
 		 461 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.85958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2073  nitrate transporter  82.43 
 
 		 460 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741347  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3079  nitrite extrusion protein  79.39 
 
 		 461 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4667  nitrite transporter  100 
 
 		 461 aa  920    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.885517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2240  nitrite extrusion protein  79.39 
 
 		 490 aa  719    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2657  nitrite transporter  68.41 
 
 		 457 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0208  nitrite transporter  69.5 
 
 		 457 aa  608  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13770  nitrite extrusion protein 2  63.24 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1233  nitrite extrusion protein 2  63.46 
 
 		 468 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2237  nitrite transporter  62.66 
 
 		 472 aa  580  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6183  cyclic nucleotide-binding protein  64.1 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0259908 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0665  nitrite transporter  60.7 
 
 		 460 aa  559  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  62.08 
 
 		 905 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0604  MFS nitrate/nitrite transporter NarK  59.17 
 
 		 459 aa  554  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  61.98 
 
 		 893 aa  551  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0660  nitrite transporter  64.24 
 
 		 487 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0426  nitrite transporter  64.88 
 
 		 481 aa  542  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2174  nitrate transporter  60.92 
 
 		 475 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.642939  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  58.28 
 
 		 912 aa  541  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0435  nitrite transporter  64.88 
 
 		 481 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1775  nitrite transporter  60.35 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1704  nitrite transporter  60.35 
 
 		 475 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0932912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  58.72 
 
 		 895 aa  531  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1108  nitrite transporter  65.17 
 
 		 486 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3863  major facilitator transporter  57.96 
 
 		 477 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  59.6 
 
 		 917 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01201  nitrate/nitrite transporter  53.91 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2422  nitrite transporter  53.91 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1374  nitrite extrusion protein 1  53.91 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0787741  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01211  hypothetical protein  53.91 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1391  nitrite extrusion protein 1  53.91 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00798499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1333  nitrite extrusion protein 1  53.91 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000558307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1707  nitrite extrusion protein 1  53.91 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2400  nitrite transporter  53.91 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2898  nitrite transporter  56.52 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1916  nitrite extrusion protein 1  53.7 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184588  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1768  nitrite transporter  50.76 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1896  nitrite extrusion protein 1  53.56 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0112468  normal  0.326955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1375  nitrite extrusion protein 1  53.56 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0207934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1901  nitrite extrusion protein 1  53.78 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0276869  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2316  nitrite transporter  52.62 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.95434  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1960  nitrite extrusion protein 1  53.03 
 
 		 465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0440291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1558  nitrite extrusion protein 1  53.56 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431226  normal  0.0433169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2225  nitrite transporter  51.52 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190366  normal  0.0765968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2301  nitrite transporter  51.52 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  59.87 
 
 		 699 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1850  nitrite transporter  51.96 
 
 		 463 aa  428  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01427  nitrate/nitrite transporter  53.51 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1705  nitrite extrusion protein 2  53.51 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0635768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2079  nitrite extrusion protein 2  53.51 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1553  nitrite extrusion protein 2  53.51 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.615088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01439  hypothetical protein  53.51 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2187  nitrite transporter  53.51 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74785  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2178  nitrite transporter  53.29 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1754  nitrite extrusion protein 2  54.49 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1766  nitrite extrusion protein 2  54.49 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.408584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1693  nitrite extrusion protein 2  54.49 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1650  nitrite extrusion protein 2  53.29 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1691  nitrite extrusion protein 2  54.49 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1585  nitrite extrusion protein 2  54.7 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1709  NO3-/NO2- ABC transporter  50.43 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2260  nitrite transporter  49.56 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2061  nitrite transporter  52.97 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2566  nitrite transporter  49.03 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2802  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 		 476 aa  360  4e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1769  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00234233  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0349  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 502 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11926  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2362  major facilitator superfamily MFS_1  45.49 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.165332  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1330  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 469 aa  336  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1313  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000040275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2725  major facilitator superfamily MFS_1  46.22 
 
 		 457 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1268  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0770735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0245  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.205061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2593  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.593061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  41.85 
 
 		 455 aa  325  9e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0837  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 450 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5685  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 455 aa  322  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4255  nitrite transporter  41.19 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.823889  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5927  nitrite extrusion protein  44.78 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0123959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2417  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000388918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3492  nitrite transporter  40.17 
 
 		 467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10271  integral membrane nitrite extrusion protein narU (nitrite facilitator)  38.44 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0502374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2166  major facilitator superfamily MFS_1  41.39 
 
 		 461 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.0459407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1822  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 440 aa  293  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.679534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6173  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2044  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1495  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 464 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3044  major facilitator superfamily MFS_1  42.15 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0440547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3015  nitrite extrusion protein  37.37 
 
 		 484 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.35043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0264  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0254  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.78177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>