More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4644 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 588 aa  1192    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  63.75 
 
 		 576 aa  718    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 588 aa  1192    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  63.34 
 
 		 598 aa  732    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  58.78 
 
 		 588 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  78.74 
 
 		 588 aa  943    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  72.8 
 
 		 602 aa  856    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  72.47 
 
 		 592 aa  871    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  76.62 
 
 		 585 aa  899    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  61.95 
 
 		 588 aa  709    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  74.15 
 
 		 587 aa  882    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  64.29 
 
 		 607 aa  749    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  63.78 
 
 		 584 aa  753    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  59.96 
 
 		 584 aa  694    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  66.67 
 
 		 598 aa  784    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  48.07 
 
 		 568 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  48.07 
 
 		 568 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  47.36 
 
 		 571 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 		 571 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  46.92 
 
 		 572 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  47.1 
 
 		 572 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  47.1 
 
 		 572 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  46.85 
 
 		 572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  46.85 
 
 		 572 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  46.75 
 
 		 572 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  47.38 
 
 		 572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  46.85 
 
 		 572 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  46.85 
 
 		 572 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  46.75 
 
 		 572 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  46 
 
 		 572 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  47.97 
 
 		 553 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  46.21 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  42.01 
 
 		 567 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2650  AMP-dependent synthetase and ligase  43.62 
 
 		 553 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  41.19 
 
 		 670 aa  403  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  41.74 
 
 		 631 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  39.77 
 
 		 632 aa  399  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  39.12 
 
 		 629 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  41.47 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  43.01 
 
 		 629 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  39.26 
 
 		 632 aa  389  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  40.89 
 
 		 635 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  41.21 
 
 		 644 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  40.43 
 
 		 625 aa  392  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  40.85 
 
 		 648 aa  388  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  40.75 
 
 		 629 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  41.03 
 
 		 652 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  41.21 
 
 		 653 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  40.39 
 
 		 631 aa  388  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  41.45 
 
 		 659 aa  388  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  41.49 
 
 		 651 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  40.46 
 
 		 639 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  39.61 
 
 		 626 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  39.22 
 
 		 631 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  39.04 
 
 		 632 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  41.03 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  38.86 
 
 		 632 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  39.67 
 
 		 655 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  38.58 
 
 		 650 aa  379  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  39.76 
 
 		 666 aa  378  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  39.93 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  39.01 
 
 		 632 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  40.45 
 
 		 667 aa  377  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  37.98 
 
 		 652 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  37.93 
 
 		 652 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  39.26 
 
 		 650 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  39.47 
 
 		 639 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  37.36 
 
 		 638 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  40.24 
 
 		 651 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  39.79 
 
 		 638 aa  369  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  40.21 
 
 		 661 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  37.41 
 
 		 652 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  38.69 
 
 		 661 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  37.94 
 
 		 660 aa  368  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  41.17 
 
 		 655 aa  365  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  39.3 
 
 		 655 aa  365  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  37.56 
 
 		 658 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  39.51 
 
 		 667 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  37.39 
 
 		 657 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 		 627 aa  362  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  39.05 
 
 		 656 aa  362  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  38.61 
 
 		 664 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  39.34 
 
 		 657 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  40.14 
 
 		 661 aa  359  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  38.27 
 
 		 656 aa  359  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  40.1 
 
 		 668 aa  359  8e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  38.77 
 
 		 657 aa  359  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  38.47 
 
 		 664 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  37.21 
 
 		 660 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  38.18 
 
 		 658 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  38.08 
 
 		 648 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  36.29 
 
 		 643 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  39.58 
 
 		 650 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  37.62 
 
 		 658 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  36.91 
 
 		 664 aa  357  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  38 
 
 		 673 aa  356  5e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  37.57 
 
 		 667 aa  356  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  38.18 
 
 		 656 aa  356  5.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>