13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4581 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4581  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  226  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.594779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3507  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  226  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.446944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4591  hypothetical protein  64.52 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6961  hypothetical protein  41.35 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2890  hypothetical protein  38.83 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0216  hypothetical protein  38.83 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0019  hypothetical protein  41.67 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0020  hypothetical protein  39.78 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0247  hypothetical protein  37.04 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5463  hypothetical protein  45.31 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3868  hypothetical protein  32.29 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5920  hypothetical protein  38.1 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.049411  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4833  hypothetical protein  31.63 
 
 		 248 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>