210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4442 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  70.5 
 
 		 685 aa  894    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  71.04 
 
 		 680 aa  908    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 		 678 aa  1316    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  71.04 
 
 		 680 aa  908    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 		 678 aa  1316    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  43.23 
 
 		 665 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  38.37 
 
 		 668 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  39.26 
 
 		 669 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  34.33 
 
 		 677 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  44.76 
 
 		 482 aa  283  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.45 
 
 		 657 aa  281  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  42.86 
 
 		 490 aa  258  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  41.54 
 
 		 487 aa  243  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  40.1 
 
 		 498 aa  242  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  40.25 
 
 		 488 aa  238  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  29.44 
 
 		 692 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  34.73 
 
 		 465 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  34 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  34 
 
 		 468 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  33.75 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  34.73 
 
 		 468 aa  193  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.73 
 
 		 468 aa  193  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  34.73 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  34.73 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  34.73 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  36.64 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  35.11 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  34.76 
 
 		 467 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  34.76 
 
 		 467 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  34.76 
 
 		 467 aa  181  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  33.83 
 
 		 466 aa  176  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  33.58 
 
 		 466 aa  174  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  33.58 
 
 		 466 aa  173  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.66 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  31.81 
 
 		 445 aa  171  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.59 
 
 		 447 aa  171  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  31.02 
 
 		 541 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  31.52 
 
 		 441 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  34.78 
 
 		 474 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  30.37 
 
 		 541 aa  165  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  31.53 
 
 		 781 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.92 
 
 		 465 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.53 
 
 		 468 aa  158  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.09 
 
 		 499 aa  157  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.44 
 
 		 462 aa  153  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 479 aa  152  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  33.33 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  34.03 
 
 		 458 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  33.9 
 
 		 452 aa  151  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  32.41 
 
 		 469 aa  150  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.25 
 
 		 453 aa  148  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.06 
 
 		 472 aa  148  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.49 
 
 		 487 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.87 
 
 		 452 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.6 
 
 		 476 aa  147  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  32.89 
 
 		 477 aa  145  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 455 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  32.49 
 
 		 452 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  30.85 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 470 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  29.4 
 
 		 454 aa  137  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.16 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 502 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.63 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.15 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  34.89 
 
 		 502 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.89 
 
 		 502 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.34 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.82 
 
 		 451 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  33 
 
 		 495 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.01 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.24 
 
 		 456 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0835  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.69 
 
 		 664 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.34 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.9 
 
 		 456 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.39 
 
 		 500 aa  127  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.59 
 
 		 457 aa  126  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  29.93 
 
 		 456 aa  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  29.45 
 
 		 477 aa  124  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  32.77 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.52 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  32.77 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 454 aa  122  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  32.77 
 
 		 507 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  32.52 
 
 		 500 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  35.57 
 
 		 472 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  32.77 
 
 		 507 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  32.77 
 
 		 507 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  32.77 
 
 		 507 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  32.53 
 
 		 507 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  32.69 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.7 
 
 		 502 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 454 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  26 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.04 
 
 		 472 aa  114  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.1 
 
 		 475 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.75 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  29 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.08 
 
 		 471 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>