More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4372 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6248  heavy metal translocating P-type ATPase  62.93 
 
 
763 aa  877    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.676922 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8719  heavy metal translocating P-type ATPase  56.58 
 
 
802 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1234  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  65.96 
 
 
763 aa  950    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6169  heavy metal translocating P-type ATPase  56.44 
 
 
776 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4504  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
763 aa  1490    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.500973 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5860  heavy metal translocating P-type ATPase  58.54 
 
 
763 aa  840    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.608727  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4372  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
763 aa  1490    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6233  heavy metal translocating P-type ATPase  59.32 
 
 
737 aa  816    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1328  putative cation-transporting ATPase  44.85 
 
 
764 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0722  heavy metal translocating P-type ATPase  45.91 
 
 
759 aa  569  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000328227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  44.83 
 
 
760 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3442  putative cation-transporting ATPase  43.9 
 
 
765 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.913125  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3767  heavy metal translocating P-type ATPase  46.48 
 
 
780 aa  552  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1648  heavy metal translocating P-type ATPase  47.94 
 
 
764 aa  545  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0284242  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1106  heavy metal translocating P-type ATPase  47.58 
 
 
774 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966149  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1079  heavy metal translocating P-type ATPase  47.58 
 
 
774 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  47.58 
 
 
774 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.167715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4993  heavy metal translocating P-type ATPase  45.89 
 
 
775 aa  528  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1385  heavy metal translocating P-type ATPase  46.57 
 
 
775 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0387619  normal  0.88801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4263  heavy metal translocating P-type ATPase  48.23 
 
 
791 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0323156  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  47.75 
 
 
618 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1580  heavy metal translocating P-type ATPase  51.59 
 
 
626 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4621  heavy metal translocating P-type ATPase  47.41 
 
 
599 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4803  heavy metal translocating P-type ATPase  46.05 
 
 
762 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457318  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1531  heavy metal translocating P-type ATPase  52.24 
 
 
626 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3027  heavy metal translocating P-type ATPase  49.49 
 
 
611 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2249  heavy metal translocating P-type ATPase  45.99 
 
 
621 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4656  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 
616 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2012  heavy metal translocating P-type ATPase  48.29 
 
 
629 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  45.5 
 
 
794 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1303  heavy metal translocating P-type ATPase  48.8 
 
 
646 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08040  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  46.9 
 
 
644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585954  normal  0.130967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0917  heavy metal translocating P-type ATPase  42.26 
 
 
641 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0394  heavy metal translocating P-type ATPase  50.26 
 
 
641 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207329  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0240  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 
627 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0340  heavy metal translocating P-type ATPase  41.92 
 
 
661 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0180  heavy metal translocating P-type ATPase  38.19 
 
 
602 aa  371  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2566  heavy metal translocating P-type ATPase  48.99 
 
 
642 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2083  heavy metal translocating P-type ATPase  43.31 
 
 
658 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3593  heavy metal translocating P-type ATPase  49.73 
 
 
637 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0078  cation transport ATPase  37.74 
 
 
593 aa  352  1e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.365296  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1826  cation transport ATPase  35.45 
 
 
630 aa  348  3e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.296097  normal  0.0201631 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1352  cation transport ATPase  35.5 
 
 
719 aa  319  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0933  heavy metal translocating P-type ATPase  35.73 
 
 
654 aa  315  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  34.13 
 
 
647 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  32.57 
 
 
630 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  36.48 
 
 
656 aa  289  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5743  heavy metal translocating P-type ATPase  37.71 
 
 
655 aa  289  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  33.79 
 
 
645 aa  286  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0009  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
743 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
751 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
755 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  37.22 
 
 
801 aa  283  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3242  heavy metal translocating P-type ATPase  37.11 
 
 
655 aa  283  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  37.87 
 
 
743 aa  280  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1348  heavy metal translocating P-type ATPase  31.77 
 
 
643 aa  279  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0452174  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  38.95 
 
 
823 aa  278  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  35.51 
 
 
750 aa  278  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  35.92 
 
 
651 aa  278  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  36.41 
 
 
639 aa  277  5e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  35.42 
 
 
655 aa  277  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24490  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  35.89 
 
 
667 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  37.41 
 
 
804 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  35.36 
 
 
818 aa  275  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
738 aa  274  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0606  heavy metal translocating P-type ATPase  36.06 
 
 
655 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.72822  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  34.94 
 
 
670 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  34.45 
 
 
628 aa  272  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3179  heavy metal translocating P-type ATPase  36.06 
 
 
655 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0324717  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0514  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
633 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  37.38 
 
 
737 aa  271  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  37.32 
 
 
846 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
734 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  34.1 
 
 
810 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  34.28 
 
 
740 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  33.17 
 
 
643 aa  271  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  34.45 
 
 
707 aa  271  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20930  heavy metal translocating P-type ATPase  31.07 
 
 
745 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000162182  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25770  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  36.5 
 
 
656 aa  270  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  37.23 
 
 
765 aa  270  8e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  31.29 
 
 
641 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  37.05 
 
 
646 aa  269  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  30.88 
 
 
641 aa  269  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  30.7 
 
 
641 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  35.76 
 
 
654 aa  268  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  36.88 
 
 
895 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2207  heavy metal translocating P-type ATPase  37.09 
 
 
656 aa  268  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  31.17 
 
 
641 aa  267  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  31.17 
 
 
641 aa  267  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  30.88 
 
 
641 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  35.33 
 
 
651 aa  266  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  36.86 
 
 
787 aa  266  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  30.53 
 
 
641 aa  266  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  30.7 
 
 
641 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  30.88 
 
 
641 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
724 aa  265  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  31.69 
 
 
894 aa  265  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  30.56 
 
 
623 aa  264  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  35.69 
 
 
755 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  36.65 
 
 
773 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>